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J-GLOBAL ID：201202228322538403   整理番号：12A0802342

黒色腫ゲノムの塩基配列解読によって明らかになった頻発性のPREX2変異

Melanoma genome sequencing reveals frequent PREX2 mutations

著者 (40件)： BERGER Michael F. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  HODIS Eran (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  LAWRENCE Michael S. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  NICKERSON Elizabeth (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  CIBULSKIS Kristian (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  SIVACHENKO Andrey Y. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  SOUGNEZ Carrie (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  ONOFRIO Robert (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  AMBROGIO Lauren (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  AUCLAIR Daniel (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  FENNELL Timothy (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  CARTER Scott L. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  STOJANOV Petar (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  VOET Douglas (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  JING Rui (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  SAKSENA Gordon (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  BARRETINA Jordi (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  RAMOS Alex H. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  PUGH Trevor J. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  STRANSKY Nicolas (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  PARKIN Melissa (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  WINCKLER Wendy (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  MAHAN Scott (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  ARDLIE Kristin (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  BALDWIN Jennifer (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  MEYERSON Matthew (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  GABRIEL Stacey B. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  GOLUB Todd R. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  LANDER Eric S. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  GETZ Gad (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  CHIN Lynda (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  GARRAWAY Levi A. (Broad Inst. of Harvard and MIT, Massachusetts, USA) ,  HEFFERNAN Timothy P. (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  DERIBE Yonathan Lissanu (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  PROTOPOPOV Alexei (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  IVANOVA Elena (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  WATSON Ian R. (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  GHOSH Papia (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  ZHANG Hailei (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA) ,  ZEID Rhamy (Dana-Farber Cancer Inst., Massachusetts, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 485  号： 7399  ページ： 502-506  発行年： 2012年05月24日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 黒色腫は,転移傾向,進行黒色腫での致死性,および若年期における紫外線暴露との関連がよく知られている。ヒト黒色腫ゲノムの全体像を得るために,25例の転移性黒色腫ゲノムとそれにマッチした生殖細胞系列のDNA塩基配列を解読した。点変異率は大幅に変動しており,最も変異率が低かったのは紫外線暴露を受けていない手足の無毛皮膚に原発巣が生じた黒色腫[ゲノムのメガベース(Mb)当たり3~14個]で,中間の変異率は体幹の有毛部皮膚に原発巣が生じた黒色腫(Mb当たり5~55個),そして変異率が最も高かったのは慢性的な日光暴露がわかっている患者の黒色腫(Mb当たり111個)だった。全ゲノム塩基配列データの解析から,乳がんにおいてPTENと相互作用するタンパク質で,PTENの負の調節因子であるPREX2(phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchange factor2)が,有意な変異遺伝子であることが明らかになり,107例のヒト黒色腫からなる独立した拡大コホートでの変異頻度は約14%であった。変異型PREX2を異所性に発現させると,in vivoでヒト不死化メラニン形成細胞の腫瘍形成が促進されることから,PREX2変異に生物学的役割があることがわかる。したがって,ヒト黒色腫の全ゲノム塩基配列解読により,紫外線による発がん作用のゲノムに基づく証拠が得られ,また,黒色腫に頻発する新しい変異遺伝子が発見された。Copyright Nature Publishing Group 2012

シソーラス用語： *黒色腫 ,  ヒト ,  ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  *癌遺伝子 ,  発癌 ,  点突然変異 ,  紫外線照射 ,  悪性黒色腫 ,  腫瘍転移
準シソーラス用語： *PREX2遺伝子 ,  転移性黒色腫

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

タイトルに関連する用語 (5件)： 黒色腫 ,  ゲノム ,  塩基配列 ,  解読 ,  変異