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J-GLOBAL ID：201202228388700210   整理番号：12A0839323

自由エネルギー計算から明らかにされたGet3のヌクレオチド依存性機構

Nucleotide-dependent mechanism of Get3 as elucidated from free energy calculations

著者 (3件)： WERESZCZYNSKI Jeff (Univ. California at San Diego, CA) ,  MCCAMMON J. Andrew (Univ. California at San Diego, CA) ,  MCCAMMON J. Andrew (Howard Hughes Medical Inst.)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 109  号： 20  ページ： 7759-7764  発行年： 2012年05月15日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Get3二量体は,尾部アンカー型(TA)蛋白質を細胞質から小胞体膜に挿入するTA蛋白質誘導挿入(GET)経路で中心的な役割を演じる。今回,多様なヌクレオチド結合状態におけるGet3の自由エネルギープロファイルを算出し,全原子分子動力学シミュレーションを行った。結果は,Get3の開及び閉状態の構造は結合しているヌクレオチド(ATPあるいはADP)による影響を受ける事を示した。これは既存の結晶構造学的に得られている結果と一致する。また1ATPと1ADPを含む非対称性Get3の存在や,半開状態のGet3が結合状態ではなく遊離状態で存在する事を示した。結果に基づいて,Get3の構造変化のモデルを提出した。

シソーラス用語： 小胞体膜 ,  *計算機シミュレーション ,  自由エネルギー ,  細胞内輸送 ,  二量体 ,  立体配座 ,  配座転移 ,  *結晶構造 ,  *膜貫通タンパク質
準シソーラス用語： *Get3蛋白質 ,  *分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生物物理学一般  (EA02020O)

タイトルに関連する用語 (3件)： 自由エネルギー計算 ,  ヌクレオチド ,  依存性