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J-GLOBAL ID：201202228840015406   整理番号：12A0413726

マイクロアレイデータに基づく分類及びクラスタリングを用いてStreptococcus pyogenesにおける毒性因子の予測

Virulence factor prediction in Streptococcus pyogenes using classification and clustering based on microarray data

著者 (4件)： LOPEZ-KLEINE Liliana (Universidad Nacional de Colombia, Departamento de Estadistica, Bogota, Colombia) ,  TORRES-AVILES Francisco (Universidad de Santiago de Chile, Departamento de Matematica y Ciencia de la Computacion, 8330111, Santiago, CHL) ,  TEJEDOR Fabio H. (Universidad Nacional de Colombia, Departamento de Estadistica, Bogota, Colombia) ,  GORDILLO Luz A. (Universidad Nacional de Colombia, Departamento de Estadistica, Bogota, Colombia)
資料名： Applied Microbiology and Biotechnology  (Applied Microbiology and Biotechnology)
巻： 93  号： 5  ページ： 2091-2098  発行年： 2012年03月 
JST資料番号： H0764A  ISSN： 0175-7598  CODEN： EJABDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現データの様な興味ある生物学的情報は公開ゲノム情報から抽出される。包括的高スループットデータ及び有用な知識を用いて生物学的知識を推論し生物学的仮説を述べる。マイクロアレイデータに基づき,病原体Streptococcus pyogenesの遺伝子によりコードされる各種蛋白質の毒性メカニズムを予測するクラスタリングと分類法の利用を調べた。予測の信頼性は既知遺伝子の分類誤差及び反復予測に基づいた。Copyright 2012 Springer-Verlag Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *DNAマイクロアレイ ,  分類 ,  クラスタ化 ,  *溶血性連鎖球菌 ,  *因子 ,  遺伝子発現 ,  遺伝情報 ,  スループット ,  病原体 ,  信頼性 ,  予測
準シソーラス用語： *Streptococcus pyogenes ,  クラスタリング ,  ゲノム情報 ,  マイクロアレイ法 ,  *毒性因子

分類 (3件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  生物学的機能  (EB03040U) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： マイクロアレイデータ ,  分類 ,  クラスタリング ,  Streptococcus ,  毒性因子 ,  予測