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J-GLOBAL ID：201202229429335986   整理番号：12A0956193

ヒトコーディングおよび非コーディングRNAにおける5-メチルシトシンの広範な発生

Widespread occurrence of 5-methylcytosine in human coding and non-coding RNA

著者 (12件)： SQUIRES Jeffrey E. (Victor Chang Cardiac Res. Inst., NSW) ,  PATEL Hardip R. (Victor Chang Cardiac Res. Inst., NSW) ,  PATEL Hardip R. (Australian National Univ., ACT) ,  NOUSCH Marco (Victor Chang Cardiac Res. Inst., NSW) ,  SIBBRITT Tennille (Australian National Univ., ACT) ,  HUMPHREYS David T. (Victor Chang Cardiac Res. Inst., NSW) ,  PARKER Brian J. (Australian National Univ., ACT) ,  SUTER Catherine M. (Victor Chang Cardiac Res. Inst., NSW) ,  SUTER Catherine M. (Univ. New South Wales, NSW, AUS) ,  PREISS Thomas (Victor Chang Cardiac Res. Inst., NSW) ,  PREISS Thomas (Australian National Univ., ACT) ,  PREISS Thomas (Univ. New South Wales, NSW, AUS)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 40  号： 11  ページ： 5023-5033  発行年： 2012年06月15日 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトトランスクリプトームを通じて修飾シトシン部位をマッピングするため,次世代の配列決定法と細胞内RNAの重亜硫酸塩転換を組み合わせた。ヒトtRNAにおける28の既知5-メチルシトシン(m⁵C)のなかで21を確認し,234の新規tRNA候補部位を同定した。mRNAおよび他の非コーディングRNAにおいて,10275の部位を見出した。RNAタイプ間の修飾シトシンの分布は,ランダムではないことを観測した。mRNA内において,これらは非翻訳領域およびArgonaute結合領域近くで濃縮されていた。また,NSUN2により修飾された5つの新しい部位を同定し,既知のその基質範囲を他のtRNA,RNアーゼPのRPPH1サブユニットおよび2つのmRNAまで広げた。

シソーラス用語： *符号化 ,  *RNA【核酸】 ,  *代謝産物 ,  トランスクリプトーム ,  ヌクレオチド配列 ,  遺伝子地図 ,  亜硫酸水素塩 ,  tRNA ,  mRNA ,  翻訳【遺伝】 ,  タンパク質 ,  基質 ,  RNアーゼP ,  窒素複素環化合物 ,  ウレア化合物
準シソーラス用語： Argonaute ,  *コーデング ,  ヌクレオチドマッピング ,  重亜硫酸塩 ,  非翻訳領域

分類 (4件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  窒素複素環化合物一般  (CF07040G) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (2件)： 5-メチルシトシン ,  シトシン

タイトルに関連する用語 (4件)： ヒト ,  コーディング ,  RNA ,  5-メチルシトシン