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J-GLOBAL ID：201202230158305120   整理番号：12A0750206

系統学的コンテキストにおける近傍-依存モデルによる代替率の正確な推定

Accurate Estimation of Substitution Rates with Neighbor-Dependent Models in a Phylogenetic Context

著者 (2件)： BERARD Jean (Inst. Camille Jordan, Lyon, FRA) ,  GUEGUEN Laurent (Lab. Biometrie et Biologie Evolutive, CNRS, Lyon, FRA)
資料名： Systematic Biology  (Systematic Biology)
巻： 61  号： 3  ページ： 510-521  発行年： 2012年05月 
JST資料番号： C0642A  ISSN： 1063-5157  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 系統発生検討において,近傍-依存モデルによる代替率の正確な推定について,系統学的コンテキストとの関連から検討した。この中で筆者らは,RN95+YpR代替モデルのクラスを考察したが,そのモデルは,ピリミジン-プリンジヌクレオチドの間の推移を通して,考慮されるべき近傍-依存性効果を出すものであった。RN95+YpRクラス内のモデル比較の結果,近傍-依存性効果を考慮することの重要性が分かった。また低メチル化アイランドの検出に対する方法を取上げ,その適用について考察した。

シソーラス用語： *系統発生 ,  生物学 ,  推定 ,  モデリング ,  利用 ,  比率 ,  メチル化 ,  ヌクレオチド ,  窒素複素環化合物
準シソーラス用語： コンテクスト ,  ピリミジン-プリンジヌクレオチド ,  近傍依存モデル ,  系統学 ,  代替 ,  代替率

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

物質索引 (2件)： ピリミジン ,  プリン

タイトルに関連する用語 (6件)： 系統学 ,  コンテキスト ,  近傍 ,  モデル ,  代替 ,  推定