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J-GLOBAL ID：201202230923835884   整理番号：12A0568610

膜を通したN-アセチル-L-トリプトファンアミドの無支援輸送:実験と速度論のシミュレーション

Unassisted Transport of N-Acetyl-l-tryptophanamide through Membrane: Experiment and Simulation of Kinetics

著者 (6件)： CARDENAS Alfredo E. (Univ. Texas at Austin, Texas, USA) ,  JAS Gouri S. (Baylor Univ., Texas, USA) ,  DELEON Kristine Y. (Baylor Univ., Texas, USA) ,  HEGEFELD Wendy A. (Baylor Univ., Texas, USA) ,  KUCZERA Krzysztof (Univ. Kansas, Kansas, USA) ,  ELBER Ron (Univ. Texas at Austin, Texas, USA)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 116  号： 9  ページ： 2739-2750  発行年： 2012年03月08日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膜を通した直接輸送,すなわち著者らが物理的または無支援透過と呼ぶ透過過程において,チャンネルとポンプのような細胞輸送機械類は膜を通す無支援物質輸送のバックグラウンドに対して仕事をする。無支援または物理的輸送を検出するため,1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン(DOPC)脂質二分子膜を通した制止されたN-アセチル-L-トリプトファンアミドの透過を調べた。実験的に輸送速度を測定し,計算上モデル化した。並行した人工膜透過試験(PAMPA)実験によって測定した時間規模は~8hである。一次元マイルストーンアルゴリズムを用いるシミュレーションは~4hの平均第一通過時間(MEPT)と二分子層中心に大きな障壁の存在を示唆した。溶解度-拡散モデルを用いた類似計算は~15minのMEPTを生じる。この透過速度はトリプトファン側鎖のみの透過速度よりも9桁ほど緩速(著者及び他の研究者が計算)である。この差は臨界的輸送時間の永久サイズと親水性度依存性を示唆する。シミュレーション結果の解析は二分子層の中に向かって透過物が動くときでさえ,透過物がペプチド主鎖に水と脂質分子へ水素結合を部分的に保存することを示唆した。結果として膜構造の欠陥が透過を支援するため発展する。

シソーラス用語： *窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  *膜透過 ,  ジグリセリド ,  *脂質二分子膜 ,  物質移動 ,  速度依存性 ,  親水性 ,  サイズ効果 ,  水素結合 ,  膜構造 ,  数学モデル ,  分子動力学 ,  計算機シミュレーション ,  *生体輸送 ,  経時変化 ,  配向ベクトル ,  水分子 ,  断面積 ,  速度論 ,  バックグラウンド ,  アルゴリズム ,  溶解度 ,  脂肪族カルボン酸 ,  オレフィン化合物 ,  不飽和カルボン酸 ,  無機酸エステル ,  第四アンモニウム ,  アミノアルコール
準シソーラス用語： サイズ依存性 ,  トリプトファン類 ,  拡散モデル ,  細胞輸送 ,  時間規模 ,  第一通過時間 ,  透過速度 ,  物質輸送 ,  分子動力学シミュレーション ,  平均力ポテンシャル ,  輸送時間

分類 (1件)： 細胞構成体一般  (EF03010Z)

物質索引 (2件)： 1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン ,  N-アセチル-L-トリプトファンアミド

タイトルに関連する用語 (6件)： N-アセチル-L-トリプトファンアミド ,  支援 ,  輸送 ,  実験 ,  速度論 ,  シミュレーション