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J-GLOBAL ID：201202231194888057   整理番号：12A0802347

転位中のリボソームに存在するtmRNA-SmpBとEF-Gの複合体

The complex of tmRNA-SmpB and EF-G on translocating ribosomes

著者 (19件)： RAMRATH David J. F. (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  YAMAMOTO Hiroshi (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  PECH Markus (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  MIELKE Thorsten (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  LOERKE Justus (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  SCHEERER Patrick (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  NIERHAUS Knud H. (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  SPAHN Christian M. T. (Charite - Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  YAMAMOTO Hiroshi (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  WITTEK Daniela (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  PECH Markus (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  IVANOV Pavel (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  TERAOKA Yoshika (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  SHPANCHENKO Olga (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  NIERHAUS Knud H. (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  ROTHER Kristian (Adam Mickiewicz Univ., Poznan, POL) ,  MIELKE Thorsten (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  IVANOV Pavel (M. V. Lomonosov Moscow State Univ., Moscow, RUS) ,  SHPANCHENKO Olga (M. V. Lomonosov Moscow State Univ., Moscow, RUS)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 485  号： 7399  ページ： 526-529  発行年： 2012年05月24日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 正常に機能しないメッセンジャーRNAの3′末端で停止した細菌のリボソームは,転移・メッセンジャーRNA(tmRNA)を介したトランス翻訳によって救済される。まずSmpBタンパク質がtmRNAと複合体を作り,tmRNAのtRNA類似ドメイン(TLD)が停止したリボソームのA部位に入る。次に,このTLD-SmpBモジュールがP部位に移動する。この過程は伸長因子EF-Gによって促進され,この後,翻訳はtmRNAのmRNA類似ドメイン(MLD)へと切り替わる。MLDをmRNAの通路に正確に配置するには,通常とは異なった開始機構が働く。さまざまなリボソーム-tmRNA複合体は,分解能が低いものから中程度のものまで,さまざまな像がとらえられているが,明確な構造を持つ大型のtmRNAを移動させる仕組みや,MLDがどのようにしてmRNA通路に入るのかは,まだ解明されていない。今回我々は,フシジン酸で停止させたリボソーム70S-tmRNA-SmpB-EF-G複合体(EF-GとtmRNAという大型リガンドを両方持っている)の分解能8.3Åでの低温電子顕微鏡再構築像を示す。この転位後中間体(TI^POST)では,TLD-SmpBモジュールがサブユニット間のap/P複合部位に,tRNA^fMetがサブユニット間のpe/E複合部位に存在する。リボソームとtmRNAのコンホメーション変化は,サブユニット間の空間の溶媒側で起こっている。基盤となる重要な動きは,30S頭部の非常に大きい独特な旋回的動きで,これがtmRNA-SmpBの転位にもMLDを配置するのにも不可欠であり,転位とMLDの配置とを結びつけている。この機構はリボソームの多様で動的な特性をよく示しており,本来ならば正統的な翻訳を行うリボソームの通常のコンホメーションが,特殊な非正統的経路での複雑な作業を促進する,修正型の翻訳にも使えることを示している。Copyright Nature Publishing Group 2012

シソーラス用語： *mRNA ,  *tRNA ,  ペプチド鎖延長因子 ,  *リボソーム ,  RNA結合タンパク質 ,  電子顕微鏡 ,  タンパク質核酸複合体 ,  高次構造 ,  サブユニット ,  立体配座 ,  ペプチジル転移
準シソーラス用語： EF-G ,  SmpB蛋白質 ,  *tmRNA ,  低温電子顕微鏡

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 転位 ,  リボソーム ,  tmRNA ,  SmpB ,  EF-G ,  複合体