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J-GLOBAL ID：201202234435632031   整理番号：12A0540080

遺伝子調節ネットワークによる乳癌転移の推論

The inference of breast cancer metastasis through gene regulatory networks

著者 (3件)： AHMAD F.k. (Graduate Dep. of Computer Sci., Universiti Utara Malaysia, 06010 Sintok, Kedah, Malaysia) ,  DERIS S. (Fac. of Computer Sci. and Information Systems, Universiti Teknologi Malaysia, 81310 Skudai, Johor, Malaysia) ,  OTHMAN N.h. (Clinical Res. Platform & Pathologist, Health Campus, Universiti Sains Malaysia, 16150 Kubang Kerian, Kelantan, Malaysia)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 45  号： 2  ページ： 350-362  発行年： 2012年04月 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子調整は,複雑な遺伝交互作用を構成すると思われるので,乳癌中に遺伝子調節の機構を理解するのは腫瘍学者間の最も難しい問題の一つである。この複雑さを考えて,Bayesネットワーク技術を用いた計算についての研究を使用してマイクロアレイデータからの遺伝子調節ネットワークを構築する。遺伝子調節プロセスを推論する傑出した手法として,Bayesネットワークを示したが,Bayesネットワーク構造の学習はNP困難であり,計算上,複雑である。したがって,筆者らは,多くの遺伝子および不十分なサンプルサイズを扱う,Bayesネットワークの場合まで及ぶ,低次元条件つき独立性に基いた新しい推論手法を提案する。この手法を評価し,全次元の条件付独立性および公に利用可能な乳癌データセットについての異なる予測インデックスと比較した。筆者らの結果は,下位の条件付独立性手法が最小平均二乗誤差を有する小標本サイズにおける大量の遺伝子を扱うことができることを示唆する。さらに,これは,手法が著しく全次数の条件付独立性およびSt.Gallen合意基準を含む他の手法より高性能であることを提案した。提案した手法は,0.79203のROC曲線下の面積を達成した。しかし,全次数の条件付独立性およびSt.Gallen合意範疇は,それぞれ,0.76438と0.73810を得た。さらに,低位の条件付の独立性手法を用いる筆者らの経験的評価は,6つの遺伝子調整器およびおよび2つの調節遺伝子の有望な関係を実証した。そして,今後,さらなる可能性のある乳癌転移予測マーカとして調査する予定である。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *腫瘍転移 ,  *乳房腫瘍 ,  ネットワーク ,  DNAマイクロアレイ ,  NP困難 ,  索引 ,  誤差 ,  特性曲線
準シソーラス用語： *遺伝子調節ネットワーク ,  *癌転移 ,  *乳癌 ,  Bayesネットワーク ,  マイクロアレイ ,  相関インデックス ,  最小平均二乗誤差 ,  ROC曲線

分類 (3件)： 医用情報処理  (JE15030Q) ,  ドキュメンテーション  (GA01020J) ,  臨床腫よう学一般  (GE03010Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 遺伝子調節ネットワーク ,  乳癌 ,  推論