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J-GLOBAL ID：201202234683508428   整理番号：12A1315657

Clostridium difficileの臨床的に関連する菌株内プロファージ運搬と多様性

Prophage Carriage and Diversity within Clinically Relevant Strains of Clostridium difficile

著者 (6件)： SHAN Jinyu (Univ. Leicester, Leicester, GBR) ,  PATEL Krusha V. (Univ. Leicester, Leicester, GBR) ,  HICKENBOTHAM Peter T. (Univ. Leicester, Leicester, GBR) ,  NALE Janet Y. (Univ. Leicester, Leicester, GBR) ,  HARGREAVES Katherine R. (Univ. Leicester, Leicester, GBR) ,  CLOKIE Martha R. J. (Univ. Leicester, Leicester, GBR)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 78  号： 17  ページ： 6027-6034  発行年： 2012年09月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Clostridium difficileの高度に柔軟性なゲノムは遺伝的に多様性であり,トランスポゾンやプロファージを含む転位要素をコードしている。臨床分離株の中でC.difficileのプロファージ運搬の広がりと多様性を確立するために,分子マーカーの設計が重要であった。C.difficile溶原性ファージミオウイルスおよびシホウイルスのそれぞれをターゲットとする縮重PCRプライマーを,ホリン遺伝子の5′および3′末端保存領域を基に設計した。C.difficileの16臨床分離菌リボタイプのPCR分析は,そのうちの15がミオウイルス陽性であり,それらの2つもシホウイルス陽性であることを示した。分子データを形態的に確認するために,ファージを電子顕微鏡によって調べた。ホリン配列の系統解析はC.difficileのファージの3つのグループ,ミオウイルス内に二つと分岐シホウイルスグループを同定した。C.difficileの臨床関連株におけるプロファージ運搬の高い発生を明らかにし,分子データと形態額的観察を相関させた。

シソーラス用語： *Clostridium difficile ,  ゲノム ,  生物多様性 ,  *プロファージ ,  DNAウイルス ,  溶菌酵素 ,  臨床分離菌 ,  生化学的分析 ,  rRNA ,  電子顕微鏡観察 ,  *溶原性ファージ ,  プライマー【遺伝】 ,  系統樹
準シソーラス用語： シホウイルス科 ,  ホリン ,  ミオウイルス科 ,  リボタイプ

分類 (2件)： ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： Clostridium ,  臨床 ,  菌株 ,  プロファージ ,  運搬 ,  多様性