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J-GLOBAL ID：201202234688593911   整理番号：12A0562832

細菌ゲノム配列を寄託し発表する場合の分類学的最小基準

Minimum taxonomic criteria for bacterial genome sequence depositions and announcements

著者 (5件)： BULL Matthew J. ,  MARCHESI Julian R. ,  VANDAMME Peter ,  PLUMMER Sue ,  MAHENTHIRALINGAM Eshwar
資料名： Journal of Microbiological Methods  (Journal of Microbiological Methods)
巻： 89  号： 1  ページ： 18-21  発行年： 2012年04月 
JST資料番号： H0882A  ISSN： 0167-7012  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マルチプルバイオインフォーマティクス法により細菌の全ゲノム配列の情報解析が可能である。しかるに分類学的に不適当なゲノム配列の寄託の事例が存在する。Lactobacillus acidophilus 30SC菌株のゲノム配列が最近寄託され,それを追試した結果,このDNAはLactobacillus amylovorusであることを実証した。本報においてバイオインフォーマティクス解析のスキームの概要を解説したこと,細菌ゲノムデータに適応する最小基準を解説したこと,データベースに寄託する前に属レベル種レベルで正確性を付与すること,この最小基準により研究者はゲノム配列寄託の分類学的正確性を信頼できることを報告した。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *細菌 ,  ヌクレオチド配列 ,  分類 ,  情報科学 ,  生物学 ,  アシドフィルス菌 ,  乳酸桿菌属 ,  データベース
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  分類学 ,  バイオインフォマティクス ,  Lactobacillus acidophilus ,  Lactobacillus amylovorus

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (1件)： 細菌ゲノム