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J-GLOBAL ID：201202234717579095   整理番号：12A0858155

グリコシル化の特異的および非特異的影響

Specific and Nonspecific Effects of Glycosylation

著者 (3件)： ELLIS Christopher R. (Pennsylvania State Univ., Pennsylvania, USA) ,  MAITI Buddhadev (Pennsylvania State Univ., Pennsylvania, USA) ,  NOID William G. (Pennsylvania State Univ., Pennsylvania, USA)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 134  号： 19  ページ： 8184-8193  発行年： 2012年05月16日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,原子的に詳細に調べられた明瞭な溶媒におけるレプリカ交換分子動態シミュレーションを通じて,配座スイッチを調べた。ペプチド配座に及ぼす特異的および非特異的相互作用影響を識別するため,これらのシミュレーションは二糖類および同じ形の立体的にこみ合っているものにN結合されたモデルペプチドを考慮した。このシミュレーションは実験とよく一致しており,ペプチド構造への詳細な洞察を与えた。N結合二糖類の立体的こみ合いは引き伸ばされた配座を除外するが,周囲の溶媒の四面体構造に有意影響を及ぼさないかまたはペプチドの自由エネルギー表面を変えないことを示唆していた。しかし,特異的水素結合による立体的こみ合いおよび疎水性スタッキング相互作用の組合せはペプチド集合に大きく影響し,新しい構造を安定化させた。

シソーラス用語： *グリコシル化 ,  溶媒 ,  レプリカ法 ,  *計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  立体配座 ,  *ペプチド ,  *二糖類 ,  四面体 ,  自由エネルギー ,  水素結合 ,  疎水性 ,  分子間相互作用
準シソーラス用語： スタッキング相互作用 ,  レプリカ交換 ,  配座 ,  *分子動態シミュレーション

分類 (4件)： 糖質・糖鎖一般  (EB06010I) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  オペレーションズリサーチ一般  (KA03010Q) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (1件)： グリコシル化