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J-GLOBAL ID：201202235190485557   整理番号：12A1612282

北西インド集団グループにおけるゲノムの多様性と類似性 Alu挿入と単一ヌクレオチド多型の解析

Genomic diversity and affinities in population groups of North West India: An analysis of Alu insertion and a single nucleotide polymorphism

著者 (6件)： SAINI J.s. (Dep. of Biomedical Sciences, State Univ. of New York at Albany, Albany, NY 12201, USA) ,  KUMAR A. (Immunology Group, International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology (ICGEB), Aruna Asif Ali Marg, New ...) ,  MATHAROO K. (Dep. of Human Genetics, Guru Nanak Dev Univ., Amritsar, IND) ,  SOKHI J. (Dep. of Human Genetics, Guru Nanak Dev Univ., Amritsar, IND) ,  BADARUDDOZA (Dep. of Human Genetics, Guru Nanak Dev Univ., Amritsar, IND) ,  BHANWER A.j.s. (Dep. of Human Genetics, Guru Nanak Dev Univ., Amritsar, IND)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 511  号： 2  ページ： 293-299  発行年： 2012年12月15日 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： インド北西地方は,ユーラシアおよび中央アジアからの外国侵入者のための重要な交通ルートの役目を果たしていたので,インドへの定住を理解する上で極めて重要である。多くの移動に伴う一連のこれらの侵入は,遺伝的変異に強く寄与する種々の集団のインターミックスをもたらした。本研究は,北西インドの5つの主要な民族;Brahmin,Jat Sikh,Bania,Rajput,Gujjar間の遺伝的多様性と類似性を明らかにするために行われた。上述した民族の合計327名について,ERS1遺伝子イントロン領域の4つのAlu挿入マーカー座(ACE,PV92,APO,D1)と1つの単一ヌクレオチド多型(SNP)を分析した。その集団グループの遺伝的構造と多様性を解釈するため統計解析を行った。ACE,APO,ESR1,PV92座はすべての民族グループでHardy-Weinberg平衡にあることが分かった,一方,有意な逸脱はBonferroni’s補正後に調べたすべての集団でD1座に認められた。これらの民族におけるすべての座の平均ヘテロ接合度は0.3927±0.1877から0.4333±0.1416までの相当大きな範囲であった。近交係数は北西インド集団のヘテロ接合度で全体で10%の減少を示した。集団間の遺伝子示差は0.013のオーダーであると認められた。遺伝距離推定は,GujjarsがBaniasに近く,Jat SikhsがRajputsに近いことを明らかにした。全体として研究は北西インド集団の大部分の族内グループへの最近の分割を支持した。北西インド集団は,地理的な近接性と共通の祖先の歴史のため,事実上均一な遺伝的エンティティを表わすことが観察された。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： インド ,  *民族 ,  ゲノム ,  *生物多様性 ,  転移性遺伝要素 ,  反復配列 ,  一塩基多型 ,  遺伝子 ,  イントロン ,  統計解析 ,  遺伝子多型 ,  DNAマーカー ,  遺伝子型 ,  係数 ,  遺伝子頻度 ,  ヘテロ接合 ,  系統樹 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： Alu挿入多型 ,  Alu配列 ,  ERS1遺伝子 ,  遺伝距離 ,  *遺伝的多様性 ,  近交係数

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： インド ,  集団 ,  グループ ,  ゲノム ,  多様性 ,  類似性 ,  ALU ,  単一ヌクレオチド多型 ,  解析