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J-GLOBAL ID：201202235238867430   整理番号：12A1519832

recA遺伝子に基づく配列決定,種特異的PCR法およびSNaPshotミニ配列決定を用いるLactobacillus acidophilus群の識別

Discrimination of the Lactobacillus acidophilus group using sequencing, species-specific PCR and SNaPshot mini-sequencing technology based on the recA gene

著者 (6件)： HUANG Chien-Hsun (Food Ind. Res. and Dev. Inst., Hsinchu, TWN) ,  CHANG Mu-Tzu (National Chung Hsing Univ., Taichung, TWN) ,  HUANG Mu-Chiou (National Chung Hsing Univ., Taichung, TWN) ,  WANG Li-Tin (Food Ind. Res. and Dev. Inst., Hsinchu, TWN) ,  HUANG Lina (Food Ind. Res. and Dev. Inst., Hsinchu, TWN) ,  LEE Fwu-Ling (Food Ind. Res. and Dev. Inst., Hsinchu, TWN)
資料名： Journal of the Science of Food and Agriculture  (Journal of the Science of Food and Agriculture)
巻： 92  号： 13  ページ： 2703-2708  発行年： 2012年10月 
JST資料番号： C0351A  ISSN： 0022-5142  CODEN： JSFAAE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lactobacillus acidophilus群は好酸性乳酸桿菌であり,ヨーグルト製造に古くから利用されている。しかし,L.acidophilus群の特定の種および亜種の識別は,表現型および遺伝子型(16S rDNA配列)の単独技術では困難である。そこで,recA遺伝子を用いて,種と亜種の配列に基づく種特異的プライマーと一塩基多型プライマーを開発した。recA遺伝子の基準株間の平均配列相同性は80.0%であり,L.acidophilus菌株の鋳型DNAのPCRを用いたrecA遺伝子配列にしたがい種特異的プライマーを設計した。L.delbrueckiiだけは単一231bp種特異的なバンドが存在し,recAを用いたスナップショットミニ配列分析を開発した。また,亜種L.delbrueckiiの31菌株で評価して,亜種L.delbrueckii亜種L.bulgaricusに属する菌株は明確に識別できた。L.acidophilus群のほとんどの菌株の系統関係は,recA遺伝子を用いた新しい方法で解明することが可能である。

シソーラス用語： *アシドフィルス菌 ,  *遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  PCR法 ,  判別分析 ,  *微生物検査 ,  プライマー【遺伝】 ,  一塩基多型 ,  遺伝学実験技術 ,  遺伝子型
準シソーラス用語： *recA遺伝子 ,  SNP解析 ,  ヌクレオチド配列決定 ,  遺伝子配列 ,  種特異的PCR ,  種特異的プライマー

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： recA遺伝子 ,  PCR法 ,  Lactobacillus ,  識別