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J-GLOBAL ID：201202237381022193   整理番号：12A1523206

アミノ酸とDNA間の相互作用をシミュレーションする:二重昇華炉を用いる1-メチルウラシル・グリシン水素結合錯体の組合せマトリックス分離FTIRと理論研究

Simulating the Interaction between Amino Acids and DNA: A Combined Matrix-Isolation FT-IR and Theoretical Study of the 1-Methyluracil Glycine H-Bond Complexes Using a Dual Sublimation Furnace

著者 (2件)： BOECKX Bram (Univ. Leuven, Leuven, BEL) ,  MAES Guido (Univ. Leuven, Leuven, BEL)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 116  号： 39  ページ： 11890-11898  発行年： 2012年10月04日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 理論計算によって1-メチルウラシルとグリシン間の水素結合錯体生成を調べ,マトリックス分離FTIRによって最も安定錯体の立体配置を同定した。すべてのDNAの生物学的機能が蛋白質との相互作用に依存しているので,この水素結合系の重要性は莫大である。理論的最適化は1-メチルウラシルとグリシン間の6種類の異なる密閉水素結合錯体を明らかにした。得たエネルギーはウラシルC⁴=O部位がC²=O部位よりも良い水素受容体であることを示した。最も安定な錯体の安定化エネルギーは-47.83(MP2)または-54.14kJ/mol(DFT)である。DFT(B3LYP)/6-31G最適化幾何構造を評価し,得たエネルギーが計算上一層高価なDFT(B3LYP)/6-31G^**アプローチの結果と一致した。アルゴンマトリックス中1:1錯体を同定するため,新しい二重小型炉を開発して最適温度で両錯体の相手を昇華することを可能にした。水素結合の周波数シフトモードの解析によって三種類のグリシン-1-メチルウラシル錯体の存在を実証した。水素結合パラメータを評価し,種々の水素結合錯体について先に得た相関を確認した。

シソーラス用語： *水素結合錯体 ,  *ピリミジン塩基 ,  *アミノ酸 ,  錯体生成 ,  分子間相互作用 ,  立体配置 ,  エネルギー ,  構造最適化 ,  *安定構造 ,  加熱炉 ,  昇華 ,  水素結合 ,  MP2法 ,  密度汎関数法 ,  汎関数 ,  基底関数系 ,  温度依存性 ,  最適化 ,  赤外吸収スペクトル ,  振動エネルギー ,  互変異性 ,  構造異性体 ,  伸縮振動【分子】 ,  周波数シフト ,  マトリックス分離 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： B3LYP ,  DFT方法 ,  FTIRスペクトル ,  マトリックス分離分光法 ,  安定化エネルギー ,  互変異性体 ,  最適温度 ,  相互作用エネルギ ,  透過スペクトル

分類 (2件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (2件)： 1-メチルウラシル ,  グリシン

タイトルに関連する用語 (13件)： アミノ酸 ,  DNA ,  相互作用 ,  シミュレーション ,  昇華 ,  1-メチルウラシル ,  グリシン ,  水素結合錯体 ,  組合せ ,  マトリックス分離 ,  FTIR ,  理論 ,  研究