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J-GLOBAL ID：201202241024560710   整理番号：12A1674100

ギャップ 系統発生学の情報の判りにくい情報源

Gaps: An Elusive Source of Phylogenetic Information

著者 (6件)： SAURABH Kumar (Massey Univ., Palmerston North, NZL) ,  HOLLAND Barbara R. (Massey Univ., Palmerston North, NZL) ,  SAURABH Kumar (Indian Inst. of Technol., Guwahati, IND) ,  HOLLAND Barbara R. (Univ. Tasmania, Hobart, AUS) ,  GIBB Gillian C. (Massey Univ., Palmerston North, NZL) ,  PENNY David (Massey Univ., Palmerston North, NZL)
資料名： Systematic Biology  (Systematic Biology)
巻： 61  号： 6  ページ： 1075-1082  発行年： 2012年12月 
JST資料番号： C0642A  ISSN： 1063-5157  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 系統発生学におけるDNA塩基配列データの取り扱い方法を考察した。系統発生学者はDNA塩基配列データを無視する。このDNAデータにおけるギャップの穴を考察した。チドリのデーター集合を事例としてDNA塩基配列データ法と系統発生法との間の3つの問題を考察した。1)ギャップの多いDNA配列データは系統発生学に有効に利用できるか?2)DNA配列と比較して系統発生学にギャップ特性は多いか?3)挿入プロセスモデル/欠失プロセスモデルは有用であるか?の3点を考察した。その結果,indelモデル(挿入プロセスモデル/欠失プロセスモデル)は情報が多いこと,この情報は系統発生学に有用であることを報告した。

シソーラス用語： 系統発生 ,  ヌクレオチド配列 ,  *チドリ類 ,  モデル
準シソーラス用語： indelモデル ,  プロセスモデル ,  塩基配列 ,  欠失プロセスモデル ,  挿入プロセスモデル

分類 (1件)： 動物分類学  (EJ01030T)

タイトルに関連する用語 (3件)： ギャップ ,  系統発生学 ,  情報源