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J-GLOBAL ID：201202243513969616   整理番号：12A0593383

脂質二分子膜モデルにおける抗微生物ペプチドCM15の比較分子動力学シミュレーション

Comparative molecular dynamics simulations of the antimicrobial peptide CM15 in model lipid bilayers

著者 (4件)： WANG Yi ,  SCHLAMADINGER Diana E. ,  KIM Judy E. ,  MCCAMMON J. Andrew
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1818  号： 5  ページ： 1402-1409  発行年： 2012年05月 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 抗微生物ペプチド(AMP)CM15の3μs比較分子動力学シミュレーションを実施し,2つの脂質二分子膜モデルのPOPC及び混合POPG:POPC(1:2)とそれの相互作用を体系的に研究した。αヘリックスまたはランダム螺旋構造から開始し,CM15は両二分子膜に挿入することを見出した。ペプチド-脂質相互作用は双性イオンPOPCよりもアニオンPOPG:POPCにおいて強く,それはCM15と負電荷POPG間の静電相互作用に顕著に寄与した。ランダム螺旋としてCM15により開始したシミュレーションにより,脂質-水界面でのペプチド折畳み研究を可能にした。興味あることに,CM15折畳みはPOPG:POPCよりもPOPCにおいて速いように思われ,それは前者の系における構造再配列の低活性化エネルギーによりおそらく説明できた。これらのデータから,ランダム螺旋構造と比較して,折畳み前αヘリックスのCM15は脂質との相互作用を顕著に低下することを示唆し,始発ペプチド構造は100ns時間スケールに関するシミュレーション結果にバイアスをかけるらしい。この結果は将来のAMPシミュレーションの実施及び解釈において考慮される必要があるだろう。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *脂質二分子膜 ,  膜模型 ,  計算機シミュレーション ,  双性イオン ,  負電荷 ,  静電相互作用 ,  折畳み構造 ,  ヘリックス構造 ,  *ペプチド系抗生物質 ,  膜脂質
準シソーラス用語： *CM15ペプチド ,  αヘリックス ,  分子動力学シミュレーション ,  *ペプチド-脂質相互作用

分類 (2件)： 抗生物質一般  (GX01000E) ,  生体膜一般  (EF04010G)

物質索引 (2件)： POPC ,  POPG

タイトルに関連する用語 (4件)： 脂質二分子膜 ,  モデル ,  抗微生物ペプチド ,  分子動力学シミュレーション