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J-GLOBAL ID：201202245386790116   整理番号：12A0795575

真核生物ゲノムアノテーションの初心者用手引書

A beginner’s guide to eukaryotic genome annotation

著者 (2件)： YANDELL Mark (Univ. Utah, Utah, USA) ,  ENCE Daniel (Univ. Utah, Utah, USA)
資料名： Nature Reviews. Genetics  (Nature Reviews. Genetics)
巻： 13  号： 5  ページ： 329-342  発行年： 2012年05月 
JST資料番号： W1326A  ISSN： 1471-0056  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本総説では費用の低下に伴い個々の研究室の仕事となり始めた真核生物のゲノムアノテーション過程全体を概説し,最適なアプローチをいくつか紹介した。まずアセンブリーの適格性の判断について述べた。アノテーションのはじめはコンピュータ段階で反復の同定,蛋白質やESTなどのアライメントの根拠,アブイニシオ遺伝子推定や証拠による遺伝子推定を行う。次のアノテーション段階では自動化されたアノテーションやデータ出力について3つの基本的アプローチと5つのカテゴリのソフトウエアを紹介した。最後にデータ品質の管理法と評価法,作成データの公開の要点について述べた。

シソーラス用語： *ゲノム ,  ab initio法 ,  *分子構造 ,  反復配列 ,  遺伝学実験技術 ,  ヌクレオチド配列 ,  タンパク質 ,  予測 ,  ソフトウェア ,  情報科学 ,  生物学
準シソーラス用語： *遺伝子構造 ,  RNA-seq ,  発現配列タグ ,  遺伝子予測 ,  分子配列アノテーション ,  ゲノムアセンブラ ,  コンバイナ ,  バイオインフォマティクス

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 真核生物 ,  ゲノム ,  アノテーション ,  初心者 ,  手引書