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J-GLOBAL ID：201202246550809172   整理番号：12A0534710

弱い一般的核酸塩基,ヒポキサンチンの実験的観測識別挙動に対する計算的提唱

A computational proposal for the experimentally observed discriminatory behavior of hypoxanthine, a weak universal nucleobase

著者 (2件)： RUTLEDGE Lesley R. (Univ. Lethbridge, Alberta, CAN) ,  WETMORE Stacey D. (Univ. Lethbridge, Alberta, CAN)
資料名： Physical Chemistry Chemical Physics  (Physical Chemistry Chemical Physics)
巻： 14  号： 8  ページ： 2743-2753  発行年： 2012年02月28日 
JST資料番号： A0271C  ISSN： 1463-9076  CODEN： PPCPFQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 六つの核酸塩基からなるモデルを用いて,最隣接水素結合と(ストランド内部およびストランド間)積層,並びに1-3積層,ヒポキサンチンを含むDNAヘリックス中の核酸塩基間相互作用を見積った。本研究のDNAモデルの計算積層相互作用は一般に,遊離ヒポキサンチン-天然核酸塩基へテロ二量体に対する計算とは天然塩基に関してその大きさと傾向が大きく偏っている。そのことは,修飾核酸塩基の大域的結合性を検出する場合のそれらの役割を評定する場合,DNAの適切な構造における積層相互作用を考慮する重要性を強調する。ストランド内及びストランド間積層相互作用はモデルDNAヘリックスの安定性に大きく寄与するが,積層相互作用における傾向は実験ストランド安定性の傾向を正しくは予測し得ない。しかし,水素結合及び積層相互作用の和を考慮すると,実験傾向は再現され得る。

シソーラス用語： *核酸塩基 ,  ヒドロキシ化合物 ,  窒素複素環化合物 ,  *モデル化合物 ,  ストランド ,  *分子間相互作用 ,  水素結合 ,  積層構造

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  ヌクレオシド,ヌクレオチド  (CF10060K) ,  分子間相互作用  (BH07020P)

物質索引 (1件)： ヒポキサンチン

タイトルに関連する用語 (8件)： 核酸塩基 ,  ヒポキサンチン ,  実験 ,  観測 ,  識別 ,  挙動 ,  計算 ,  提唱