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J-GLOBAL ID：201202247562362854   整理番号：12A0521718

線虫の進化:染色体規模の選択的スウィープ(周辺領域の多様性の消失)は線虫のゲノムの多様性を作り出す

Chromosome-scale selective sweeps shape Caenorhabditis elegans genomic diversity

著者 (8件)： ANDERSEN Erik C (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  GERKE Justin P (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  SHAPIRO Joshua A (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  CRISSMAN Jonathan R (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  GHOSH Rajarshi (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  BLOOM Joshua S (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  KRUGLYAK Leonid (Princeton Univ., New Jersey, USA) ,  FELIX Marie-Anne (Inst. of Biology of the Ecole Normale Superieure, Paris, FRA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 44  号： 3  ページ： 285-290  発行年： 2012年03月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 線虫Caenorhabditis elegansは分子,細胞,発生学研究の中心にあるが,この研究のほとんどすべてはC.elegansの単一の株を使って行われてきた。この種の集団ゲノム学や進化の歴史についてはまったく知られていない。世界中から集められた200種のC.elegans野生株について,高処理能力の標的塩基配列決定法を使い遺伝的な変種を検討し,41,188個のSNPを同定した。とりわけ,C. elegansのゲノムの差異には6つの染色体中の4つについて共通に見られるハプロタイプが主だっており,それぞれは数メガベースにわたっていた。集団遺伝学のモデルでは,このパターンは染色体規模の選択的スウィープ(周辺領域の多様性の消失)により,世界中の変種の減少が見られた。少なくともこれらのスウィープの1つは,おそらくここ最近数百年の間に起こっている。こうしたスウィープは,人類の活動の結果であろうと推測され,世界中のC.elegans集団は,この近年に抜本的に再構築されてきたと考えられる。Copyright Nature Publishing Group 2012

シソーラス用語： *Caenorhabditis elegans ,  生物多様性 ,  ゲノム ,  分子進化 ,  染色体 ,  ハプロタイプ ,  集団遺伝 ,  ヌクレオチド配列 ,  一塩基多型 ,  系統樹
準シソーラス用語： SNP ,  遺伝的多様性 ,  変種

分類 (1件)： 集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (8件)： 線虫 ,  進化 ,  染色体 ,  規模 ,  スウィープ ,  周辺領域 ,  多様性 ,  ゲノム