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J-GLOBAL ID：201202248306106545   整理番号：12A0892750

翻訳における直交性RNA調節因子の合理的な設計ファミリー

Rationally designed families of orthogonal RNA regulators of translation

著者 (12件)： MUTALIK Vivek K (Lawrence Berkeley National Lab., California, USA) ,  MUTALIK Vivek K (Joint Bioenergy Inst., California, USA) ,  MUTALIK Vivek K (California Inst. Quantitative Sci., California, USA) ,  QI Lei (Univ. California, California, USA) ,  GUIMARAES Joao C (Univ. California, California, USA) ,  GUIMARAES Joao C (Univ. Minho, Braga, PRT) ,  LUCKS Julius B (Univ. California, California, USA) ,  LUCKS Julius B (Miller Inst. Basic Scientific Res., California, USA) ,  ARKIN Adam P (Lawrence Berkeley National Lab., California, USA) ,  ARKIN Adam P (Joint Bioenergy Inst., California, USA) ,  ARKIN Adam P (California Inst. Quantitative Sci., California, USA) ,  ARKIN Adam P (Univ. California, California, USA)
資料名： Nature Chemical Biology  (Nature Chemical Biology)
巻： 8  号： 5  ページ： 447-454  発行年： 2012年05月 
JST資料番号： W2213A  ISSN： 1552-4450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大腸菌の>500のRNA-RNA相互作用を定量化するための挿入配列IS10由来のアンチセンスRNA媒介性翻訳制御システム(RNA-IN-RNA-OUTシステム)の合理的バリアントライブラリーの定量的アッセイから,最小複雑性に基づく最大予測データ駆動性配列-活性モデルを示した。何百ものin vitroレポーターアッセイのモデル統合により,アンチセンスRNAの相互作用特異性の重要な決定因子を同定した。その後,モデルを用いて付加的な~2600のアンチセンス-調節因子ペアのパフォーマンスを予測し,新たな直交性変異体ペアを設計することでこの予測を実験的に評価した。この研究は,制御性要素機能の予想モデルをパラメータ化するための仮説駆動性ライブラリー構築の有用性を証明した。これらのモデルはこれらの要素活性化の重要な機構を洞察し,アンチセンスRNAファミリーの新たな要素産生のためのコンピュータ支援設計を提供する。

シソーラス用語： 翻訳【遺伝】 ,  *アンチセンスRNA ,  *分子設計 ,  *挿入配列 ,  *ドラッグデザイン ,  CAD【計算機】 ,  *遺伝的調節
準シソーラス用語： *IS10 ,  合理的薬物設計 ,  *翻訳調節

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 翻訳 ,  直交性 ,  RNA ,  調節因子 ,  設計 ,  ファミリー