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J-GLOBAL ID：201202250398379792   整理番号：12A1717155

ゲノムワイド解析は長い非コードRNA遺伝子座におけるエピジェネティクス特徴の明確なパターンを明らかにする

Genome-wide analysis reveals distinct patterns of epigenetic features in long non-coding RNA loci

著者 (5件)： SATI Satish (CSIR, Delhi, IND) ,  GHOSH Sourav (CSIR, Delhi, IND) ,  JAIN Vaibhav (CSIR, Delhi, IND) ,  SCARIA Vinod (CSIR, Delhi, IND) ,  SENGUPTA And Shantanu (CSIR, Delhi, IND)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 40  号： 20  ページ： 10018-10031  発行年： 2012年11月09日 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 種々の細胞段階を表す4つの細胞タイプおよび3つの組織タイプにおける長い非コードRNA(lncRNA)の転写開始部位(TSS)と関連した汎ゲノムDNAメチル化およびヒストン修飾マーク(H3K4me3,H3K9me3,H3K27me3およびH3K36me3を解析した。抑制的ヒストンマークH3K27me3とともに活性転写H3K4me3およびH3K36me3と関連したヒストンマークは,細胞タイプと関係なくTSS周辺に類似の分布パターンを持つことを観測した。また,これらのマークの密度は,蛋白質-コーディングおよびlncRNA遺伝子の発現を相関していた。対照的に,lncRNAは,その発現状態と関係なく蛋白質-コーディング遺伝子よりTSS周辺に高いメチル化密度を持っていた。さらに,他の抑制的ヒストンマークH3K27me3を伴うDNAメチル化は,lncRNA発現において役割を演じていないようであることを見出した。

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,  解析 ,  *RNA【核酸】 ,  *遺伝子座 ,  *遺伝学 ,  ヌクレオチド ,  転写【遺伝】 ,  メチル化 ,  DNA【核酸】 ,  ゲノム ,  化学修飾 ,  ヒストン ,  タンパク質 ,  符号化 ,  遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  *エピジェネティクス ,  *ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  コーデング ,  ヒストン修飾 ,  転写開始部位 ,  *非コードRNA

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  付加反応,脱離反応  (CF02030M)

タイトルに関連する用語 (5件)： ゲノム ,  解析 ,  非コードRNA ,  遺伝子座 ,  エピジェネティクス