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J-GLOBAL ID：201202251106109192   整理番号：12A1010051

実時間PCR分析のための2つの色素及び1或は2つの消光剤DNAプローブ:合成及びTaqMan^TMプローブとの比較

Two-dye and one- or two-quencher DNA probes for real-time PCR assay: synthesis and comparison with a TaqMan probe

著者 (9件)： RYAZANTSEV Dmitry Y. (Shemyakin-Ovchinnikov Inst. of Bioorganic Chemistry, Miklukho-Maklaya 16/10, 117997, Moscow, RUS) ,  TSYBULSKY Dmitry A. (Inst. of Physical Organic Chemistry, Surganova 13, 220072, Minsk, Belarus) ,  PROKHORENKO Igor A. (Shemyakin-Ovchinnikov Inst. of Bioorganic Chemistry, Miklukho-Maklaya 16/10, 117997, Moscow, RUS) ,  KVACH Maksim V. (Inst. of Physical Organic Chemistry, Surganova 13, 220072, Minsk, Belarus) ,  MARTYNENKO Yury V. (Inst. of Physical Organic Chemistry, Surganova 13, 220072, Minsk, Belarus) ,  PHILIPCHENKO Pavel M. (Primetech LLC, Surganova 13, 220072, Minsk, Belarus) ,  SHMANAI Vadim V. (Inst. of Physical Organic Chemistry, Surganova 13, 220072, Minsk, Belarus) ,  KORSHUN Vladimir A. (Shemyakin-Ovchinnikov Inst. of Bioorganic Chemistry, Miklukho-Maklaya 16/10, 117997, Moscow, RUS) ,  ZAVRIEV Sergey K. (Shemyakin-Ovchinnikov Inst. of Bioorganic Chemistry, Miklukho-Maklaya 16/10, 117997, Moscow, RUS)
資料名： Analytical & Bioanalytical Chemistry  (Analytical & Bioanalytical Chemistry)
巻： 404  号： 1  ページ： 59-68  発行年： 2012年07月 
JST資料番号： E0425B  ISSN： 1618-2642  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 典型的TaqMan^TM実時間PCRプローブは5′-蛍光色素及び3′-消光剤を含む。増幅中にプローブは5′-端から出発して分解した蛍光色素を放出した。いくつかのフルオロフォア(フルオレセインを含む)は互いに近くに位置すると自己-消光し易いことが知られている。この研究は増加修飾DNAプローブにおける色素-色素及び色素-消光剤相互作用を調べることを目的とした。1つ或は2つのフルオレセイン(FAM)或はFAM-JOE対及び1或は2BHQ1消光剤を含む21蛍光発生プローブを非-ヌクレオシド試薬及び固相上及び溶液中の”クリック化学”修正後を用いて合成した。プローブはテンプレートとして~300-bp-長天然DNA断片を用いて実時間PCR中で試験した。プローブの背景蛍光を低める,及び終端プラトー蛍光強度を増加させる構造的必要条件を評価し,議論した。Copyright 2012 Springer-Verlag Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *RT-PCR法 ,  *消光剤 ,  *DNAプローブ ,  *色素 ,  *蛍光体 ,  発色団 ,  化学合成 ,  消光 ,  ラクトン ,  スピロ化合物 ,  フェノール類 ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： *TaqMan法 ,  *蛍光色素 ,  フルオロホア ,  クリック化学 ,  蛍光消光

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： フルオレセイン

引用文献 (41件)：

• Heid CA, Stevens J, Livak KJ, Williams PM (1996) Real time quantitative PCR. Genome Res 6:986-994
• Arya M, Shergill IS, Williamson M, Gommersall L, Arya N, Patel HRH (2005) Basic principles of real-time quantitative PCR. Expert Rev Mol Diagn 5:209-219
• Ranasinghe RT, Brown T (2005) Fluorescence based strategies for genetic analysis. Chem Commun 5487-5502 pp
• Gibson NJ (2006) The use of real-time PCR methods in DNA sequence variation analysis. Clin Chim Acta 363:32-47
• Kubista M, Andrade JM, Bengtsson M, Forootan A, Jonák J, Lind K, Sindelka R, Sjöback R, Sjögreen B, Strömbom L, Ståhlberg A, Zoric N (2006) The real-time polymerase chain reaction. Mol Asp Med 27:95-125

タイトルに関連する用語 (7件)： 実時間 ,  PCR ,  分析 ,  色素 ,  消光剤 ,  DNAプローブ ,  プローブ