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J-GLOBAL ID：201202253392205244   整理番号：12A0540147

蛋白質における曖昧さの無いHN,CA及びN同定のための減次元3D HNCAN

Reduced dimensionality 3D HNCAN for unambiguous HN, CA and N assignment in proteins

著者 (5件)： ROUT Manoj Kumar (Dep. of Chemical Sciences, Tata Inst. of Fundamental Res. (TIFR), Mumbai 400 005, IND) ,  MISHRA Pushpa (Dep. of Chemical Sciences, Tata Inst. of Fundamental Res. (TIFR), Mumbai 400 005, IND) ,  ATREYA Hanudatta S. (NMR Res. Centre, Indian Inst. of Sci., Bangalore 560 012, IND) ,  HOSUR Ramakrishna V. (Dep. of Chemical Sciences, Tata Inst. of Fundamental Res. (TIFR), Mumbai 400 005, IND) ,  HOSUR Ramakrishna V. (UM-DAE Centre for Excellence in Basic Sciences, Mumbai Univ. Campus, Kalina, Mumbai 400 098, IND)
資料名： Journal of Magnetic Resonance  (Journal of Magnetic Resonance)
巻： 216  ページ： 161-168  発行年： 2012年03月 
JST資料番号： D0079D  ISSN： 1090-7807  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ここでは,折り畳まれた或いは折り畳まれていない蛋白質のバックボーン(HN,CA及び¹⁵N)の同定のためのRD 3D HNCANと呼ばれる,HNN(Panchal, Bhavesh et al.,2001)の即席実験を示す。これは減次元の実験であり,CAの化学シフトを分散の改善のために使用する。HNNで観察されるポリペプチド鎖に沿った種々の三重項部分の明確な正及び負のピークパタンを保持し,そしてこれらが逐次的な歩みのスタートとチェックポイントを与える。CAと¹⁵Nの共増分のために,一つの次元に沿ったピークはCAと¹⁵Nの化学シフトの和と差のところに現れる。これはバックボーンの同定手順を僅かに変更する,そしてこれを陽に詳細に示す。実験はユビキチン及び熱帯熱マラリア原虫P2蛋白質を用いて遂行し示した。実験は,二つの隣接するアミノ酸残基がおよそ同一のバックボーン¹⁵N化学シフトを有するとき,特に価値がある。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *炭素 ,  *窒素15NMR ,  タンパク質 ,  ユビキチン ,  Plasmodium falciparum ,  *化学シフト ,  三重項 ,  アミド ,  分子構造
準シソーラス用語： *αカーボン ,  蛋白質構造 ,  熱帯熱マラリア原虫

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  NMR一般  (BM07041R)

タイトルに関連する用語 (6件)： 蛋白質 ,  曖昧さ ,  Ca ,  同定 ,  次元 ,  3D