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J-GLOBAL ID：201202256034643760   整理番号：12A1347833

分子動態フレキシブルフィッティング法による低温電子顕微鏡法のモデル化

Cryo-Electron Microscopy Modeling by the Molecular Dynamics Flexible Fitting Method

著者 (5件)： CHAN Kwok-Yan (Univ. Illinois at Urbana-Champaign, IL) ,  TRABUCO Leonardo G. (Univ. Heidelberg, Heidelberg, DEU) ,  SCHREINER Eduard (Univ. Illinois at Urbana-Champaign, IL) ,  SCHREINER Eduard (BASF, Ludwigshafen, DEU) ,  SCHULTEN Klaus (Univ. Illinois at Urbana-Champaign, IL)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 97  号： 9  ページ： 678-686  発行年： 2012年09月 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 構造生物学において低温電子顕微鏡法(cryo-EM)は,ハイブリッド法を用いることで通常の分解能以上に,密度マップでの原子モデル化を可能にする方法である。Cryo-EMモデル化チャレンジ2010は,ハイブリッド法開発者やcryo-EM実験者のための最初の取り組みとして開催された。著者らは,分子動態フレキシブルフィッティング(MDFF)法を,GroEL,GroEL-GroES複合体,Mm-cpn,アクアポリン-0,ロタウイルスVP6,細菌リボソームのcryo-EM密度マップ(2.5~8Å)に適用した。原子モデルは,対称な複合体の密度マップから生じた原子モデルの質を改良するための,対称性に基づいた制限,また立体化学的エラーを検出して防止するための,異なるハイブリッド法による原子モデルの立体化学的特質の比較,さらに電子線結晶学データへのMDFF適用の3点を重要視することで,得られた。

シソーラス用語： 分子構造 ,  分解能 ,  モデリング ,  *電子顕微鏡観察 ,  *分子動力学 ,  *計算機シミュレーション ,  シャペロンタンパク質 ,  水チャンネル ,  リボソーム ,  ロタウイルス
準シソーラス用語： GroEL ,  GroES ,  MDFF ,  アクアポリン ,  蛋白質構造 ,  *低温電子顕微鏡観察 ,  分子モデリング ,  *分子動力学シミュレーション

分類 (3件)： 生体の顕微鏡観察法  (EA03050C) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 分子 ,  フィッティング ,  低温電子顕微鏡法 ,  モデル化