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J-GLOBAL ID：201202266448120918   整理番号：12A1712160

Markov状態モデルシミュレーションに基づくTrpzip2温度依存非折畳み蛍光線形状の構造起源を調べる

Investigating the Structural Origin of Trpzip2 Temperature Dependent Unfolding Fluorescence Line Shape Based on a Markov State Model Simulation

著者 (8件)： SONG Jian (Dalian Inst. of Chemical Physics, Dalian, CHN) ,  SONG Jian (Henan Normal Univ., Henan, CHN) ,  GAO Fang (Inst. of Intelligent Machines, Chinese Acad. of Sci., Hefei, CHN) ,  CUI Raymond Z. (Hong Kong Univ. Sci. and Technol., Hong Kong) ,  SHUANG Feng (Inst. of Intelligent Machines, Chinese Acad. of Sci., Hefei, CHN) ,  LIANG Wanzhen (Xiamen Univ., Xiamen, CHN) ,  HUANG Xuhui (Hong Kong Univ. Sci. and Technol., Hong Kong) ,  ZHUANG Wei (Dalian Inst. of Chemical Physics, Dalian, CHN)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 116  号： 42  ページ： 12669-12676  発行年： 2012年10月25日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二組の温度(300と350K)と同様に温度ジャンプ非折畳み過程でβヘアピンペプチドTrpzip2におけるトリプトファン残基,特に内部部分として選択したトリプトファンの3-メチルインドール部分の振動分解蛍光スペクトルをシミュレーションした。スペクトルシミュレーションはMarkov状態モデルと量子力学/分子力学の量子化学スキームの組合せを使用した。励起子-フォノン結合を考慮することによって幅広い非対称スペクトル線形特性を再現した。実験中に観測した温度依存赤方偏移は特異な発色団の状態集団交換に割付けた。更なる理論研究を通して,環境の電場と発色団の幾何学歪の両者がトリプトファンの蛍光シフトに係わっていることを見いだした。

シソーラス用語： *ヘアピン構造 ,  β構造 ,  *折畳み構造 ,  蛍光スペクトル ,  *スペクトルシミュレーション ,  温度依存性 ,  *温度ジャンプ法 ,  確率モデル ,  Markov過程 ,  量子化学 ,  スペクトル線形 ,  アミノ酸残基 ,  分子内力学 ,  量子論 ,  励起子 ,  励起子-フォノン相互作用 ,  赤方偏移 ,  発色団 ,  電場効果 ,  励起エネルギー ,  二面角 ,  時間依存性 ,  遷移エネルギー ,  電位 ,  幾何学量 ,  立体配座 ,  *化学緩和
準シソーラス用語： Markovモデル ,  非折畳み ,  分子力学 ,  量子力学 ,  量子力学/分子力学法 ,  幾何学的パラメータ ,  発蛍光団

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  有機化合物のルミネセンス  (BM08094A)

物質索引 (1件)： 3-メチルインドール

タイトルに関連する用語 (5件)： シミュレーション ,  温度依存 ,  非折畳み ,  蛍光 ,  起源