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J-GLOBAL ID：201202266834198689   整理番号：12A0231523

Soap nutトリプシン阻害剤のin silicoモデリング及びドッキング研究

In silico modeling and docking studies of Soap Nut Trypsin Inhibitor

著者 (5件)： RACHEL K. Vijaya (Dep. of Biochemistry/Bioinformatics, GITAM Univ., Visakhapatnam 530045, IND) ,  SOLMON K. Sandeep (Dep. of Biochemistry/Bioinformatics, GITAM Univ., Visakhapatnam 530045, IND) ,  KIRANMAYI P. (Dep. of Biochemistry/Bioinformatics, GITAM Univ., Visakhapatnam 530045, IND) ,  REDDY I. Bhaskar (Dep. of Biochemistry/Bioinformatics, GITAM Univ., Visakhapatnam 530045, IND) ,  PRASAD D. Siva (Dep. of Biochemistry, Andhra Univ., Visakhapatnam 530003, IND)
資料名： Process Biochemistry  (Process Biochemistry)
巻： 47  号： 3  ページ： 453-459  発行年： 2012年03月 
JST資料番号： C0250B  ISSN： 1359-5113  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 阻害蛋白質であるSoap nutトリプシン阻害剤(SNT1)はSapindus trifoliatusの種子から硫酸アンモニウム沈殿とイオン交換及びゲル濾過クロマトグラフィーにより単離精製しPAGEにより均一であることを確認した。MALDITOFによるプロテオミクスにより阻害剤はMASCOTソフトウェアを用い配列決定し解析した。3Dモデルからin silico相同モデリングで構造を予測した。SNP1構造とウシトリプシンの構造間のドッキング相互作用はClusPro2.0を用い検討した。受容体結合ドメインのアミノ酸残基はSNT1と3MFJ(ウシトリプシン)間の蛋白質-蛋白質相互作用に重要な役割を示した。SNT1はふけ原因真菌に対する抗真菌活性を示した。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *ムクロジ科 ,  *トリプシン阻害剤 ,  モデリング ,  ドッキング ,  *計算機シミュレーション ,  種子 ,  精製 ,  プロテオミクス ,  アミノ酸配列 ,  シミュレーション ,  ウシ ,  トリプシン ,  アミノ酸残基 ,  分子間相互作用 ,  抗真菌作用 ,  系統樹
準シソーラス用語： 3Dシミュレーション ,  in silico解析 ,  Sapindus trifoliatus ,  *Soap nut ,  ドッキングシミュレーション ,  ムクロジ属 ,  蛋白質-蛋白質相互作用

分類 (3件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

タイトルに関連する用語 (5件)： SOAP ,  トリプシン阻害剤 ,  モデリング ,  ドッキング ,  研究