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J-GLOBAL ID：201202267959149139   整理番号：12A0962083

Lactococcus lactis感染936様ファージの特性を評価するための多重座配列タイピングスキーム

Multilocus Sequence Typing Scheme for the Characterization of 936-Like Phages Infecting Lactococcus lactis

著者 (2件)： MOISAN Maxim (Univ. Laval, Quebec, CAN) ,  MOINEAU Sylvain (Univ. Laval, Quebec, CAN)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 78  号： 13  ページ： 4646-4653  発行年： 2012年07月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： チーズスターター乳酸菌のファージ感染は経済的損失の大きな要因で,最も流布している936様ファージの寄与を多重座配列タイピング(MLST)で検証した。このMLST系では,パッケージング,形態形成,溶菌モジュールに関わる5つの非常に保存されたゲノム配列の内部部分を標的にしている。1971年から2010年に11か国で分離された制限断片長多型(RFLP)パターンの異なる100ファージを解析し,93の異なる配列型を検出した。それぞれのファージに対してPCRを行い,MLST系の識別能力が高いことを明らかにした。エンドリシンコードlys遺伝子内の保存遺伝子座が最も識別しやすく,65の対立遺伝子が存在した。主要キャプシド蛋白質mcp遺伝子内の遺伝子座が最もよく保存されており,54の対立遺伝子が存在した。各配列の系統解析の結果,クラスターとファージの宿主域がよく一致しており,これらのファージがクローン進化したことが示唆された。

シソーラス用語： *バクテリオファージ ,  遺伝学実験技術 ,  ウイルス遺伝子 ,  RFLP ,  生物分類 ,  バイオマーカー ,  宿主域 ,  *乳酸連鎖球菌 ,  *チーズスターター ,  系統発生
準シソーラス用語： MLST法 ,  *乳酸菌ファージ

分類 (2件)： ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U) ,  チーズ  (FJ12025C)

タイトルに関連する用語 (6件)： Lactococcus ,  感染 ,  ファージ ,  評価 ,  多重座配列タイピング ,  スキーム