文献

J-GLOBAL ID：201202268398782755   整理番号：12A0693443

Ceriporiopsis subvermisporaとPhanerochaete chrysosporiumの比較ゲノミクスは選択的リグニン分解への洞察を提供する

Comparative genomics of Ceriporiopsis subvermispora and Phanerochaete chrysosporium provide insight into selective ligninolysis

著者 (40件)： FERNANDEZ-FUEYO Elena (Consejo Superior de Investigaciones Cientificas, Madrid, ESP) ,  RUIZ-DUENAS Francisco J. (Consejo Superior de Investigaciones Cientificas, Madrid, ESP) ,  FERREIRA Patricia (Univ. Zaragoza, Zaragoza, ESP) ,  FLOUDAS Dimitrios (Clark Univ., MA) ,  HIBBETT David S. (Clark Univ., MA) ,  CANESSA Paulo (Pontificia Universidad Catolica de Chile, Santiago, CHL) ,  LARRONDO Luis F. (Pontificia Universidad Catolica de Chile, Santiago, CHL) ,  JAMES Tim Y. (Univ. Michigan, MI) ,  SEELENFREUND Daniela (Universidad de Chile, Santiago, CHL) ,  LOBOS Sergio (Universidad de Chile, Santiago, CHL) ,  POLANCO Ruben (Universidad Andres Bello, Santiago, CHL) ,  TELLO Mario (Universidad de Santiago de Chile, Santiago, CHL) ,  HONDA Yoichi (Kyoto Univ., Uji, JPN) ,  WATANABE Takahito (Kyoto Univ., Uji, JPN) ,  WATANABE Takashi (Kyoto Univ., Uji, JPN) ,  SAN Ryu Jae (Gyeongnam Agricultural Res. and Extension Serv., Gyeongnam, KOR) ,  KUBICEK Christian P. (Technische Univ. Wien, Vienna, AUT) ,  SCHMOLL Monika (Technische Univ. Wien, Vienna, AUT) ,  GASKELL Jill (Forest Serv., US Dep. Agriculture, WI) ,  HAMMEL Kenneth E. (Forest Serv., US Dep. Agriculture, WI) ,  ST. JOHN Franz J. (Forest Serv., US Dep. Agriculture, WI) ,  WYMELENBERG Amber Vanden (Univ. Wisconsin, WI) ,  SABAT Grzegorz (Univ. Wisconsin Biotechnology Center, WI) ,  BONDURANT Sandra Splinter (Univ. Wisconsin Biotechnology Center, WI) ,  SYED Khajamohiddin (Univ. Cincinnati, OH) ,  YADAV Jagjit S. (Univ. Cincinnati, OH) ,  DODDAPANENI Harshavardhan (Univ. Iowa, IA) ,  SUBRAMANIAN Venkataramanan (Colorado School of Mines, CO) ,  LAVIN Jose L. (Public Univ. Navarre, Pamplona, ESP) ,  OGUIZA Jose A. (Public Univ. Navarre, Pamplona, ESP) ,  PEREZ Gumer (Public Univ. Navarre, Pamplona, ESP) ,  PISABARRO Antonio G. (Public Univ. Navarre, Pamplona, ESP) ,  RAMIREZ Lucia (Public Univ. Navarre, Pamplona, ESP) ,  SANTOYO Francisco (Public Univ. Navarre, Pamplona, ESP) ,  MASTER Emma (Univ. Toronto, ON, CAN) ,  COUTINHO Pedro M. (Aix-Marseille Univ., Marseille, FRA) ,  HENRISSAT Bernard (Aix-Marseille Univ., Marseille, FRA) ,  LOMBARD Vincent (Aix-Marseille Univ., Marseille, FRA) ,  MAGNUSON Jon Karl ,  KUEES Ursula
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 109  号： 14  ページ： 5458-5463  発行年： 2012年04月03日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 効率的リグニン分解は,木材分解担子菌類に特有である。Phanerochaete chrysosporiumはリグニンとセルロースを同時に分解するが,密接に関連する種であるCeriporiopsis subvermisporaはリグニンを分解するがセルロース分解は弱い。この選択的リグニン分解に対する分子基盤を,両者の比較ゲノム解析により行った。マンガンペルオキシダーゼ遺伝子はC.subvermisporaとP.chrysosporiumそれぞれで13個,5個であった。C.subvermisporaはラッカーゼ遺伝子を少なくとも7個持ち,MnP蛋白質を培養液で同定できたが,P.chrysosporiumはラッカーゼを持たず,MnP蛋白質も検出できなかった。C.subvermisporaの遺伝子発現パターンから,P.chrysosporiumと比較してオキシドレダクターゼ潜在性の増加とセルロース分解能の減少を示唆した。

シソーラス用語： 系統樹 ,  *微生物分解 ,  *担子菌類 ,  Phanerochaete ,  分解 ,  *真菌類 ,  オキシドレダクターゼ ,  *遺伝学 ,  ペルオキシダーゼ ,  タンパク質 ,  ジフェノールオキシドレダクターゼ
準シソーラス用語： *リグニン分解 ,  Ceriporiopsis subvermispora ,  Phanerochaete chrysosporium ,  セルロース分解 ,  *比較ゲノム ,  マンガンペルオキシダーゼ ,  MnP蛋白質 ,  ラッカーゼ

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  木材化学  (FF05040V)

タイトルに関連する用語 (5件)： Phanerochaete ,  Chrysosporium ,  比較ゲノミクス ,  リグニン分解 ,  洞察