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J-GLOBAL ID：201202268445849090   整理番号：12A1211645

双安定RNAヘアピン間の立体構造的スイッチの速度論的機構

Kinetic Mechanism of Conformational Switch between Bistable RNA Hairpins

著者 (2件)： XU Xiaojun (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  CHEN Shi-Jie (Univ. Missouri, Missouri, USA)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 134  号： 30  ページ： 12499-12507  発行年： 2012年08月01日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 双安定のRNAヘアピン間の立体構造のスイッチに関する速度論的機構を速度論的Monte Carlo法で検討した。その結果,RNAヘアピンに関する3種の立体配座スイッチ経路(完全に展開した後の再折り畳み,塩基対の交換経路を介した折り畳み,及び疑似結び目で援助された経路を介した折り畳み)を見出した。立体配座スイッチ経路の選定は,2つの双安定ヘアピン間の構造的な関係に依存して決定されることが,Arrheniusプロットによる活性化エネルギー及びNMR分光学的データによって支持された。

シソーラス用語： 折畳み構造 ,  安定性 ,  *RNA【核酸】 ,  ヘアピン構造 ,  塩基対 ,  Arrheniusの式 ,  活性化エネルギー ,  モンテカルロ法 ,  反応速度論 ,  ヌクレオチド配列

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 双安定 ,  RNA ,  立体構造 ,  速度論