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J-GLOBAL ID：201202268899269306   整理番号：12A0766294

遺伝子型予測:ベイズ法を用いて遺伝子発現データから個人のSNP遺伝子型を予測する

Bayesian method to predict individual SNP genotypes from gene expression data

著者 (4件)： SCHADT Eric E (Mount Sinai School of Medicine, New York, USA) ,  HAO Ke (Mount Sinai School of Medicine, New York, USA) ,  WOO Sangsoon (Univ. Washington, Washington, USA) ,  HAO Ke (Rosetta Inpharmatics, Washington, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 44  号： 5  ページ： 603-608  発行年： 2012年05月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNAプロファイリングを用いると,発現の量的形質座位(eQTL)と関連する多くの遺伝子の発現パターンをとらえることが可能である。これまでに報告された暫定的なシスeQTLを用いることにより,RNA発現データのみに基づいて,SNP遺伝子型を予測するベイズ法を用いた手法を開発した。予測された遺伝子型は大きな集団中から,個人を正確に,また各個人を区別して同定することができた。(独立した集団から得られた)同じタイプの組織のeQTLを用いた発現データセットから遺伝子型を推測すると,その集団中の個人をP_adjusted≦1×10^-5で,99%識別することができた。1つの組織から得られたeQTLを用いて,他の組織から得られた発現データの遺伝子型を予測すると,対象者の90%の識別がP_adjusted≦1×10^-5で可能であった。公共データベースに登録されたRNAデータから得られる遺伝子型情報の意味について議論する。Copyright Nature Publishing Group 2012

シソーラス用語： *Bayes推定 ,  遺伝子発現 ,  *一塩基多型 ,  遺伝子型 ,  ヒト ,  個体差 ,  量的形質遺伝子座 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： *eQTL ,  *SNP

分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子型 ,  予測 ,  ベイズ法 ,  遺伝子発現データ ,  個人 ,  SNP