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J-GLOBAL ID：201202269973105937   整理番号：12A0377277

メタゲノムからゲノムを紡いで:海洋性ユリ古細菌門(Euryarchaeota)の培養されないクラスの解明

Untangling Genomes from Metagenomes: Revealing an Uncultured Class of Marine Euryarchaeota

著者 (6件)： IVERSON Vaughn (Univ. Washington, WA, USA) ,  MORRIS Robert M. (Univ. Washington, WA, USA) ,  FRAZAR Christian D. (Univ. Washington, WA, USA) ,  BERTHIAUME Chris T. (Univ. Washington, WA, USA) ,  MORALES Rhonda L. (Univ. Washington, WA, USA) ,  ARMBRUST E. Virginia (Univ. Washington, WA, USA)
資料名： Science  (Science)
巻： 335  号： 6068  ページ： 587-590  発行年： 2012年02月03日 
JST資料番号： E0078A  ISSN： 0036-8075  CODEN： SCIEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生態系での難培養性微生物を解析するため,メイトペアで短く読まれたメタゲノムから直接にゲノムを再構成する方法を開発した。この方法により,海洋グループIIのEuryarchaeotaのゲノムを,表層海水のメタゲノム配列の1.7%からde novoに構築した。このゲノムによれば,この微生物は運動性の光-従属栄養生物で,蛋白質と脂質を分解し,起源となる原始的なプロテオロドプシンを有していた。このように,この方法を用いれば,株間の変異に起因するゲノム再構成の困難を克服し,難培養性微生物が生態系で果たす役割を推論できることが示された。

シソーラス用語： *古細菌 ,  *ゲノム ,  微生物 ,  プロトンポンプ ,  色素タンパク質 ,  微生物タンパク質 ,  遺伝学実験技術
準シソーラス用語： *Euryarchaeota ,  *メタゲノム ,  難培養性微生物 ,  プロテオロドプシン ,  メイトペア法

分類 (2件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (8件)： メタゲノム ,  ゲノム ,  海洋 ,  ユリ ,  古細菌 ,  Euryarchaeota ,  培養 ,  クラス