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J-GLOBAL ID：201202271577499382   整理番号：12A1009613

トウモロコシ:トウモロコシHapMap2によって同定された,ゲノム流入後失われずに現存する多様性

Maize HapMap2 identifies extant variation from a genome in flux

著者 (40件)： CHIA Jer-Ming (Cold Spring Harbor Lab., New York, USA) ,  GELLER Laura (Cold Spring Harbor Lab., New York, USA) ,  MCCOMBIE Richard (Cold Spring Harbor Lab., New York, USA) ,  WARE Doreen (Cold Spring Harbor Lab., New York, USA) ,  SONG Chi (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  LIU Xin (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  WANG Jun (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  XU Xun (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  ZHANG Gengyun (BGI-Shenzhen, Shenzhen, CHN) ,  BRADBURY Peter J (Cornell Univ., New York, USA) ,  COSTICH Denise (Cornell Univ., New York, USA) ,  ELSHIRE Robert J (Cornell Univ., New York, USA) ,  GLAUBITZ Jeffrey C (Cornell Univ., New York, USA) ,  LI Meng (Cornell Univ., New York, USA) ,  SUN Qi (Cornell Univ., New York, USA) ,  TIAN Feng (Cornell Univ., New York, USA) ,  ZHANG Zhiwu (Cornell Univ., New York, USA) ,  BUCKLER Edward S (Cornell Univ., New York, USA) ,  BRADBURY Peter J (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  COSTICH Denise (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  GORE Michael (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  GUILL Kate E (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  HOLLAND Jim (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  POLAND Jesse (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  MCMULLEN Michael D (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  BUCKLER Edward S (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  WARE Doreen (US Dep. of Agriculture-Agriculture Res. Serv. (USDA-ARS)) ,  DE LEON Natalia (Univ. Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  SEKHON Rajandeep S (Univ. Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  KAEPPLER Shawn M (Univ. Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  DOEBLEY John (Univ. Wisconsin, Wisconsin, USA) ,  GAUT Brandon (Univ. California, Irvine, California, USA) ,  TENAILLON Maud I (Univ. California, Irvine, California, USA) ,  GORE Michael (US Arid-Land Agricultural Res. Center, Arizona, USA) ,  GUILL Kate E (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  MCMULLEN Michael D (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  HOLLAND Jim (North Carolina State Univ., North Carolina, USA) ,  HUFFORD Matthew B (Univ. California, Davis, California, USA) ,  PYHAEJAERVI Tanja (Univ. California, Davis, California, USA) ,  ROSS-IBARRA Jeffrey (Univ. California, Davis, California, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 44  号： 7  ページ： 803-807  発行年： 2012年07月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トウモロコシの収穫高向上のために,育種家は遺伝的多様性を大いに利用している。ところが,栽培種でない品種の有用な対立遺伝子を利用するという点では,あまり進展が見られていない。複雑なトウモロコシゲノムに固定化された多様性を特性解析することは困難であり,これまでに明らかになっているのはそのうちのほんのわずかにすぎない。そこで集団遺伝学スコアリングモデルを考案し,これを用いて特性解析を行い,103におよぶ栽培化以前(野生種)および以降(栽培種)のトウモロコシZea maysの系統から,5,500万のSNPを同定した。対象となった系統の中にはトウモロコシの近縁植物であるトリプサクム属Tripsacumも含まれる。また,トウモロコシゲノムの広範囲にゲノム構造の変化が存在しており,しかもこの構造変化が栽培上の重要な形質に関連する座位に多く認められることも見つけた。さらに,ゲノムサイズの違いをもたらしているものの本体について詳細に調べ,ゲノムサイズの大きなトリプサクムの場合には,異質倍数体起源というよりも,転移因子が多数存在しているためであることを明らかにした。それに対して,同一種内におけるゲノムサイズの差は,染色体瘤(chromosomal knob)の含有量に左右されていると思われた。ここで,トウモロコシとトリプサクムでは,主要な遺伝子が驚くほど一致していた。この事実は,トリプサクムが持つ適応(例えば,多年生,耐霜性や耐乾性)に関する遺伝子群がトウモロコシに取り込まれる可能性が高いことを示唆している。Copyright Nature Publishing Group 2012

シソーラス用語： *トウモロコシ ,  *一塩基多型 ,  ハプロタイプ ,  ゲノム ,  集団遺伝 ,  遺伝子座 ,  転移性遺伝要素 ,  イネ科 ,  生物多様性 ,  栽培
準シソーラス用語： HapMap2 ,  *SNP ,  Tripsacum ,  遺伝的多様性

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  トウモロコシ  (FC03034D)

タイトルに関連する用語 (5件)： トウモロコシ ,  同定 ,  ゲノム ,  流入 ,  多様性