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J-GLOBAL ID：201202271762814324   整理番号：12A1157635

重水素試料から得られたまばらなNMRデータとCS-Rosettaを用いた,40kDaまでの蛋白質の溶液構造の決定

Determination of solution structures of proteins up to 40kDa using CS-Rosetta with sparse NMR data from deuterated samples

著者 (13件)： LANGE Oliver F. (Technische Univ. Muenchen, Garching, DEU) ,  LANGE Oliver F. (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  ROSSI Paolo (State Univ. New Jersey, NJ) ,  SGOURAKIS Nikolaos G. (Univ. Washington, WA) ,  SONG Yifan (Univ. Washington, WA) ,  LEE Hsiau-Wei (Univ. Georgia, GA) ,  ARAMINI James M. (State Univ. New Jersey, NJ) ,  ERTEKIN Asli (State Univ. New Jersey, NJ) ,  XIAO Rong (State Univ. New Jersey, NJ) ,  ACTON Thomas B. (State Univ. New Jersey, NJ) ,  MONTELIONE Gaetano T. (State Univ. New Jersey, NJ) ,  MONTELIONE Gaetano T. (Univ. Medicine and Dentistry of New Jersey, NJ) ,  BAKER David (Univ. Washington, WA)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 109  号： 27  ページ： 10873-10878  発行年： 2012年07月03日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 20kDaを超える蛋白質のNMR構造を決定する手法を開発した。この手法は,重水素試料に対して最適化された分光学的実験を利用して得られたまばらな距離制約を活用するものであり,最終的にRASERC Rosetta NMR構造計算へと導くものである。15~40kDaの11種類の蛋白質(うち7つは先に検討したもの)にこの手法を応用してみたところ,RASERC Rossetaモデルは,伝統的なNMR手法を用いて得られたモデルと良い一致をみた。5つのケースにおいては,X線構造を測定あるいはそれを有効活用可能であり,そこからRsettaモデルと一般的なNMRモデルとの正確性を比較することが可能であった。5種類,いずれのケースにおいてもRosettaモデルはよりX線構造に類似し,それは骨格および側鎖の立体構造ともに一般的NMR手法で得られた構造よりもX線構造に類似していた。RASREC Rosettaに距離抑制を取り入れることは,40kDaまでの蛋白質の高分解能NMR構造のルーチンな測定を可能ならしめるものであり,構造生物学の領域で広く利用価値があると考えられる。

シソーラス用語： 重水素 ,  化学修飾 ,  *NMR【磁気共鳴】 ,  立体配座 ,  X線構造解析 ,  遺伝的アルゴリズム ,  *糖タンパク質 ,  分子構造 ,  NOESY
準シソーラス用語： *マルトース結合蛋白質 ,  構造ゲノミクス ,  溶液構造【溶質】

分類 (2件)： 有機化合物のNMR  (BM07044Q) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 重水素 ,  試料 ,  NMR ,  蛋白質 ,  溶液構造