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J-GLOBAL ID：201202271909774234   整理番号：12A0565268

テトラサイクリン結合アプタマーの立体構造上の動態

Conformational dynamics of the tetracycline-binding aptamer

著者 (5件)： FOERSTER Ute (Goethe-Univ. Frankfurt) ,  WEIGAND Julia E. (Goethe-Univ.-Frankfurt, Frankfurt am Main, DEU) ,  TROJANOWSKI Peter (Goethe-Univ. Frankfurt) ,  SUESS Beatrix (Goethe-Univ.-Frankfurt, Frankfurt am Main, DEU) ,  WACHTVEITL Josef (Goethe-Univ. Frankfurt)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 40  号： 4  ページ： 1807-1817  発行年： 2012年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： テトラサイクリン結合アプタマーへのリガンド結合により誘導される立体構造の動態を調べたところ,標識リガンドの蛍光は結合の間,及び後のアプタマーの三次構造内の変化に感受性であった。アプタマーへのリガンド結合に関する大変速い二段階機構を示唆する結果が得られた。これは結合とそれに引き続いて起こるリガンドを適応させるためのアプタマーの再組織化として説明される。2つの別個の接触点A13及びA50への結合は最初の結合段階で起こった。A9G変異は全結合過程を大幅に減じた。これは塩基A9が欠くアプタマーの三次構造の著しい喪失を示し,テトラサイクリン結合アプタマーの全結合過程に対する前組織化の重要性を強調する。

シソーラス用語： *核酸 ,  *結合 ,  *配座転移 ,  三次構造 ,  結合部位 ,  突然変異体 ,  分子間相互作用 ,  反応速度論 ,  親和性 ,  エノール ,  芳香族ケトン ,  フェノール類 ,  カルボアミド ,  エノン ,  芳香族縮合化合物 ,  アミノアルコール ,  ケト酸 ,  ジケトン ,  第三アミン ,  ヒドロキシ酸 ,  ヒドロキシケトン ,  ポリオール
準シソーラス用語： *アプタマー ,  *リガンド結合 ,  *立体配座変化 ,  結合親和性

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： テトラサイクリン

タイトルに関連する用語 (3件)： テトラサイクリン ,  アプタマー ,  立体構造