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J-GLOBAL ID：201202273665653300   整理番号：12A0971203

鋳型は構造的に特性化された蛋白質のほぼすべての複合体のモデル化に利用できる

Templates are available to model nearly all complexes of structurally characterized proteins

著者 (4件)： KUNDROTAS Petras J. (Univ. Kansas, KS) ,  ZHU Zhengwei (Univ. California, CA) ,  JANIN Joeel (Univ. Paris-Sud 11, Orsay, FRA) ,  VAKSER Ilya A. (Univ. Kansas, KS)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 109  号： 24  ページ： 9438-9441  発行年： 2012年06月12日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質間ドッキング解析においては実験的に決定された複合体構造(鋳型)をドッキング予測に使用するが,鋳型の利用性が問題となっている。古細菌からヒトの771種にわたる126897の蛋白質間相互作用に関するアミノ酸配列の大規模な総合的解析により,蛋白質データバンクには限られた数の蛋白質-蛋白質複合体しか登録されていないにもかかわらず,ほぼすべての既知の複合体蛋白質間相互作用解析のためのドッキングの鋳型を発見できることを明らかにした。データバンクから抽出した配列特異的検証セットは実験結果と比較すると,約1/3の鋳型が品質的に良好で,複合体モデリングに有用と考えられた。以上の知見は,蛋白質相互作用モデル化の可能性を劇的に拡大すると考えられる。

シソーラス用語： 分子モデル ,  *アミノ酸配列 ,  データベース ,  *タンパク質複合体 ,  分子 ,  分子認識 ,  結合部位 ,  分子間相互作用
準シソーラス用語： ホモロジーモデル ,  鋳型分子

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： 鋳型 ,  特性化 ,  蛋白質 ,  複合体 ,  モデル化