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J-GLOBAL ID：201202273888489510   整理番号：12A0551242

高いmRNA-タンパク質発現相関および共発現相関を持つ遺伝子の発見のための質基準

Quality criteria for finding genes with high mRNA-protein expression correlation and coexpression correlation

著者 (2件)： OESTLUND Gabriel ,  SONNHAMMER Erik L.L.
資料名： Gene  (Gene)
巻： 497  号： 2  ページ： 228-236  発行年： 2012年04月15日 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： mRNAの発現はタンパク質の発現の代用として広く用いられている。しかし,それらの真の関係は知られておらず,同じmRNAレベルを伴う2つの遺伝子は,異なる存在量の各々のタンパク質を示すかも知れない。関連する疑問は遺伝子対のmRNAの共発現レベルが対応するタンパク質対に反映されているかである。我々は発現と共発現の両方に関してmRNA-タンパク質の相関を調べた。この分析はmRNAおよびタンパク質存在量の間の関連に関する洞察を産み出し,一群のより大きいmRNA-タンパク質整合性の同定を可能にした。mRNAとタンパク質との間の相関は,発現と共発現に関し,それぞれ0.12および0.06と共に低かった。しかし,最良実行品質尺度を適用することにより,高品位である一群は,スピアマン相関は発現に関し0.31,共発現に関し0.34,機能的に共役した遺伝子に制限したとき共発現に関し0.49に達した。従って,我々の方法論はmRNAレベルがタンパク質に最大に相関することが期待される一群を同定できる。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *遺伝子発現 ,  タンパク質合成 ,  *分子遺伝現象 ,  DNAマイクロアレイ ,  比率 ,  相関係数 ,  mRNA ,  *相関
準シソーラス用語： 共発現 ,  *蛋白質発現 ,  尺度 ,  品質尺度

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： mRNA ,  タンパク質 ,  発現 ,  相関 ,  共発現 ,  遺伝子 ,  発見 ,  質