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J-GLOBAL ID：201202283015248130   整理番号：12A0604246

ナス科の種におけるAux/IAA遺伝子ファミリーのトマトをモデルとして用いたゲノムワイド解析

Genome-wide analysis of Aux/IAA gene family in Solanaceae species using tomato as a model

著者 (8件)： WU Jian (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  PENG Zhen (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  LIU Songyu (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  HE Yanjun (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  CHENG Lin (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  KONG Fuling (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  WANG Jie (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...) ,  LU Gang (Zhejiang Univ., Key Lab. of Horticultural Plant Growth, Dev. and Biotechnology, Agricultural Ministry of China, Dep. ...)
資料名： Molecular Genetics and Genomics  (Molecular Genetics and Genomics)
巻： 287  号： 4  ページ： 295-311  発行年： 2012年04月 
JST資料番号： C0025C  ISSN： 1617-4615  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： オーキシンは植物の活動において重要な役割を演じている。Aux/IAA遺伝子はオーキシン伝達経路の調節因子であるが,Aux/IAA遺伝子の機能は不明である。本研究では,ナス科のAux/IAA遺伝子ファミリーの系統的解析を行うために,オーキシン応答遺伝子ホモログのゲノムワイド検索を行った。トマトおよびジャガイモにおいて,それぞれ26および27種類のAUX/IAA遺伝子が同定された。トマトをモデルに,遺伝子構造や系統発生など含むSlIAA遺伝子ファミリーの包括的概観が示された。31種類のOsIAA,29種類のAtIAA,31種類のZmIAAおよび26種類のSlIAAの予測タンパク質配列のアライメントから作製した系統樹により,これらのIAAは3種類のグループと10種類のサブグループにクラスター化され,7種類のサブグループは単子葉植物種と双子葉植物種に存在したことから,IAAファミリーの機能的多様化は単子葉植物と双子葉植物の分岐前から存在することが示された。グループCと他のサブグループは種特異的と推定された。26種類のSlIAA遺伝子の内の19種類は全てのトマトの器官や組織で検出されたが,7種類は一部のトマトの組織に特異的に発現された。17種類のSlIAA遺伝子の転写産物量は,実生を外来性のIAAで処理した数時間以内に増加し,6種類のSlIAA遺伝子では減少した。殆どのSIIAA遺伝子ファミリー遺伝子は3種類のストレス処理の内の少なくとも1つに応答したが,トマトの実生における異なる非生物的ストレス条件下では,SIIAA遺伝子ファミリーは多様な発現レベルを示した。SlIAA20遺伝子,SlIAA21遺伝子およびSlIAA22遺伝子では,少なくとも1つのストレス関連シス-エレメントがそのプロモーター領域に同定されたが,ストレス処理により影響を受けなかった。以上より,トマトにおけるAux/IAA遺伝子ファミリーメンバーの進化および種々の組織およびオーキシンやストレスに対する応答における発現パターンに関する識見が得られ,ナス科におけるAUX/IAA遺伝子ファミリーメンバーのクローニングと機能的解析のための有用な参照が得られた。Copyright 2012 Springer-Verlag Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 組織特異性 ,  ナス科 ,  トマト ,  *オーキシン ,  プロモーター領域 ,  *遺伝子 ,  遺伝学実験技術 ,  *解析 ,  系統樹 ,  構造 ,  単子葉植物 ,  双子葉植物 ,  応答 ,  カルボン酸 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物
準シソーラス用語： *Aux遺伝子 ,  *IAA遺伝子 ,  配列アラインメント ,  *系統解析 ,  クラスター構造 ,  ストレス応答

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  植物の生化学  (EH01050J)

物質索引 (1件)： インドール酢酸

タイトルに関連する用語 (8件)： ナス科 ,  種 ,  IAA ,  遺伝子ファミリー ,  トマト ,  モデル ,  ゲノム ,  解析