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J-GLOBAL ID：201202284761189153   整理番号：12A1773080

超希薄なサンプリング,高ダイナミックレンジのアーチファクト抑制および時間分割NOESYを用いた急速な蛋白質球状折畳の決定

Rapid Protein Global Fold Determination Using Ultrasparse Sampling, High-Dynamic Range Artifact Suppression, and Time-Shared NOESY

著者 (4件)： COGGINS Brian E. (Duke Univ. Medical Center, North Carolina, USA) ,  WERNER-ALLEN Jonathan W. (Duke Univ. Medical Center, North Carolina, USA) ,  YAN Anthony (Duke Univ. Medical Center, North Carolina, USA) ,  ZHOU Pei (Duke Univ. Medical Center, North Carolina, USA)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 134  号： 45  ページ： 18619-18630  発行年： 2012年11月14日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： NMRによる蛋白質構造決定における径制限は広がっているが,多数のプロトンシグナルによるNOESYスペクトルの共鳴重複を含む課題が残る。今回,超希薄なサンプリング,新規データ処理アルゴリズムと4D時間分割NOESYを用いた解析について報告した。高分解能での選択的プロトン化アミドとIleδ1,LeuとVal(ILV)メチル基の²H/¹³C/¹⁵N標識蛋白質試料における全ての核オーバーハウザー(NOE)の収集と完全自動化共鳴帰属を用いたデータから球状折畳の計算を行った。新規アルゴリズムSCRUBを反復アーチファクト除去のためにCLEAN法と組み合わせたが,これを更なる繰り返しレベルに応用し,ノイズから真のシグナルを区別した。4D時間分割NOESYデータに応用し,SCRUB処理は強対角シグナルからのノイズを減少した。本方法を23kDaと29kDa蛋白質の構造計算に用い,その有用性を示した。

シソーラス用語： *折畳み構造 ,  ダイナミックレンジ ,  アーチファクト ,  時分割処理 ,  *NOESY ,  アルゴリズム ,  プロトン化 ,  Overhauser効果 ,  構造計算
準シソーラス用語： 4D画像 ,  核Overhauser効果 ,  蛋白質折畳み

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  有機化合物のNMR  (BM07044Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： サンプリング ,  高ダイナミックレンジ ,  アーチファクト ,  時間分割 ,  NOESY ,  蛋白質 ,  球状 ,  折畳