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J-GLOBAL ID：201202288578500457   整理番号：12A1353177

同重核質量のリポータイオンアイソトポログを用いるTMTの多重化容量の増加

Increasing the Multiplexing Capacity of TMTs Using Reporter Ion Isotopologues with Isobaric Masses

著者 (11件)： MCALISTER Graeme C. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  HUTTLIN Edward L. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  HAAS Wilhelm (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  TING Lily (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  JEDRYCHOWSKI Mark P. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  ROGERS John C. (Thermo Fisher Scientific, Illinois, USA) ,  KUHN Karsten (Proteome Sci. plc, Cobham, GBR) ,  PIKE Ian (Proteome Sci. plc, Cobham, GBR) ,  GROTHE Robert A. (Thermo Fisher Scientific, California, USA) ,  BLETHROW Justin D. (Thermo Fisher Scientific, California, USA) ,  GYGI Steven P. (Harvard Medical School, Massachusetts, USA)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 84  号： 17  ページ： 7469-7478  発行年： 2012年09月04日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 同位体対¹⁵Nと¹⁴N並びに対¹³Cと¹²C間の相対質量差を調べ,TMT 6-plex試薬の多重化容量を拡大させる方法を提案した。定量的質量分析法によって包括的なプロテオーム研究が可能であるが,これらの方法のスループットはまだ十分と言えない。TMT(tandem mass tag),iTRAQなどの同重核化学標識を用いる多重定量法が質量分析ベースプロテオームにおける貴重な実験手段になることから,本研究ではTMT同重核試薬のスループットを6-plexから8-plexまで拡大させる方法を提示した。この方法は¹³Cに対して¹⁵Nを置換することによって生じる同位体シフトの決定能力をベースにしたもので,この置換によって得られる新規TMTリポータイオンは6.32mDa軽いものであった。これらのリポータイオンにおけるアイソトポログ間の質量差は,このように小さいが,高解像度と質量の正確さを有する現代の分析計によればこれらのイオンを十分に解明することができる。TMTリポータイオンの構造を考慮すれば,少なくとも10-plex,おそらく18-plexにまでTMT試薬の多重化容量を拡大させることも可能であるとみられる。

シソーラス用語： *試薬 ,  *標識 ,  *容量 ,  窒素複素環化合物 ,  同重核 ,  アイソトポマ ,  イオン ,  構造異性体 ,  タンデム質量分析 ,  プロテオーム ,  スループット ,  同位体シフト ,  炭素同位体 ,  窒素同位体 ,  質量差 ,  HeLa細胞 ,  ペプチド ,  LC-MS分析 ,  データ解析
準シソーラス用語： iTRAQ試薬 ,  LC-MS/MS分析 ,  *TMT試薬 ,  ピリジン誘導体 ,  リポータイオン ,  窒素14

分類 (1件)： 分析試薬  (CC02030D)

タイトルに関連する用語 (4件)： 同重核 ,  質量 ,  TMT ,  多重化