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J-GLOBAL ID：201202291574985813   整理番号：12A0937275

ピラノース環パッカリングのアノマ立体配置依存性:メチルイドピラノシド

Dependence of Pyranose Ring Puckering on Anomeric Configuration: Methyl Idopyranosides

著者 (7件)： SATTELLE Benedict M. (Univ. Manchester, Manchester, GBR) ,  BOSE-BASU Bidisha (Univ. Notre Dame, Indiana, USA) ,  TESSIER Matthew (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  WOODS Robert J. (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  WOODS Robert J. (National Univ. Ireland, Galway, IRL) ,  SERIANNI Anthony S. (Univ. Notre Dame, Indiana, USA) ,  ALMOND Andrew (Univ. Manchester, Manchester, GBR)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 116  号： 22  ページ： 6380-6386  発行年： 2012年06月07日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アルドヘキソピラノースイドースにおいて,三種類の軸位環ヒドロキシル基のユニークな存在はかなり立体配座柔軟性を生じ,環パッカリングとアノマ立体配置間の関係を合理化する実験と優れたモデルを調べることを困難にする。GLYCAM11とTIP3P,TIP4P及びTIP4P-EW明示水モデルを用いる速度論的に厳しい10μsシミュレーションからメチルα-とβ-L-イドピラノシドの環パッカリングを予測した。水はグリコシド結合構造に影響することによって少糖類立体配座を定義する上で重要役割を演じる。水と水モデルがピラノース環パッカリングに及ぼす効果は調べられていない。各事例で,NMR測定を用い計算ピラノース環の三結合(微傾斜)¹H-¹Hスピン結合(³J_H,H)は傾向を示した。パッカリング交換速度と自由エネルギーから計算したこれらの値が水モデルに無関係であった。α-とβ-アノマはそれらの個別トラジェクトリーの85と>99%に対する¹C₄鎖であり,20/μsと1/μsの速度で¹C₄→⁴C₁交換を受けた。計算α-アノマの¹C₄⇔⁴C₁パッカリング速度は環外C6置換基に依存し,先の研究からカルボキシルとヒドロキシメチルを比較した。アノマ1-O-メチルとC6ヒドロキシメチル置換基によって結合した空洞を占有する水によってβ-アノマの緩速速度論と拘束擬回転プロフィルをもたらした。この知見は種々のα-とβ-L-イドピラノシド³J_H,H値を合理化した。イドピラノースアノマ立体配置,μsパッカリング及び水構造間の関係を同定することは生物学的と商業的に重要誘導体の工学を容易にし,グリコームにおける構造-機能相関を下支えする。

シソーラス用語： *少糖類 ,  *環パッカリング ,  ジアステレオマ ,  *立体配座 ,  柔軟性 ,  立体配置 ,  水モデル ,  スピン-スピン相互作用 ,  *構造活性相関 ,  糖鎖 ,  分子動力学 ,  計算機シミュレーション ,  陽子磁気共鳴 ,  炭素13NMR ,  MASNMR ,  化学シフト ,  動径分布関数 ,  自由エネルギー ,  トラジェクトリー ,  グリコシド化 ,  化学結合
準シソーラス用語： アノマ ,  グリコーム ,  グリコシド結合 ,  スピン結合 ,  スピン-スピン結合 ,  構造-機能相関 ,  分子動力学シミュレーション ,  分子立体配座 ,  立体配座柔軟性

分類 (1件)： 少糖類  (CF10053Y)

物質索引 (2件)： 1-O-メチル-α-L-イドピラノース ,  1-O-メチル-β-L-イドピラノース

タイトルに関連する用語 (4件)： 環パッカリング ,  アノマ ,  立体配置 ,  依存性