文献

J-GLOBAL ID：201202291659875588   整理番号：12A0930696

Sanger,454と照度配列データを用いた糸状菌のde novoゲノム配列組立

De novo sequencing and a comprehensive analysis of purple sweet potato (Impomoea batatas L.) transcriptome

著者 (9件)： XIE Fuliang (East Carolina Univ., Dep. of Biology, 27858, Greenville, NC, USA) ,  BURKLEW Caitlin E. (East Carolina Univ., Dep. of Biology, 27858, Greenville, NC, USA) ,  YANG Yanfang (Chinese Acad. of Forestry, The Res. Inst. of Forestry, 100091, Beijing, CHN) ,  YANG Yanfang (State Key Lab of Tree Genetics and Breeding, No. 2 DongXiaoFu, 100091, Beijing, Haidian District,, CHN) ,  LIU Min (Agriculture Univ. of Beijing, Coll. of Plant Sci., 102206, Beijing, CHN) ,  XIAO Peng (East Carolina Univ., Dep. of Mathematics, 27858, Greenville, NC, USA) ,  ZHANG Baohong (East Carolina Univ., Dep. of Biology, 27858, Greenville, NC, USA) ,  QIU Deyou (Chinese Acad. of Forestry, The Res. Inst. of Forestry, 100091, Beijing, CHN) ,  QIU Deyou (State Key Lab of Tree Genetics and Breeding, No. 2 DongXiaoFu, 100091, Beijing, Haidian District,, CHN)
資料名： Planta  (Planta)
巻： 236  号： 1  ページ： 101-113  発行年： 2012年07月 
JST資料番号： C0607A  ISSN： 0032-0935  CODEN： PLANAB  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 合成技術による配列分析はde novoゲノム組立の発生コストを低減する。異なるソースからの配列情報を統合する真核生物のドラフトゲノム配列組立法を報告し,その有効性を子嚢菌である森林病原菌のGrosmannia clavigeraの約32.5Mbのゲノム配列を組立ることにより実証した。また,照度対端データを読むによりドラフト組立法を開発し,将来の配列分析にどのようにしてそれを用いるかを実証した。これらの結果により真核生物ゲノム配列が照度,454およびSanger配列データの組合せにより正確に組立できることを実証した。Copyright 2012 Springer-Verlag Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *糸状菌類 ,  *ゲノム ,  植物病原菌 ,  照度 ,  真核生物 ,  アントシアニン ,  サツマイモ ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： de novo合成 ,  RNA配列解析 ,  ゲノム配列 ,  マイクロサテライトマーカー ,  遺伝子配列 ,  配列分析

分類 (2件)： 微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： 照度 ,  糸状菌 ,  ゲノム配列 ,  組立