特許
J-GLOBAL ID：201203055120178210
遺伝子コピー数の変化のパターンに基づいた結腸直腸癌のゲノム分類
発明者：
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出願人/特許権者：
代理人 (1件)：
特許業務法人川口國際特許事務所
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2011-534722
公開番号（公開出願番号）：特表2012-507798
出願日： 2009年10月28日
公開日（公表日）： 2012年03月29日
要約：
本発明は、結腸直腸癌細胞をゲノムプロファイルによって分類することができる方法およびキット、ならびにその方法およびキットを使用して、臨床試験および治療のために臨床転帰を診断し、予測し、患者集団を階層化する方法を対象とする。
請求項（抜粋）：
結腸直腸癌ゲノムサブグループのデータベースを得るための方法であって、
(a)少なくとも1つのCRC細胞を含む、細胞系または腫瘍を含む複数のm個の試料を得るステップ、
(b)ステップ(a)において得られた各試料から、各染色体からの少なくとも1つの遺伝子座からのコピー数の変化の情報を含むデータセットを取得するステップ、
(c)
(1)腫瘍試料と正常試料の間の差異を表すパラメータに合わせた機械学習アルゴリズムをデータに適用すること、
(2)機械学習アルゴリズムによって決定される、正常細胞の混入に対する確率スコアを各試料に割り当てること、
(3)正常細胞を含有する確率が50%以上であるとスコア化する各試料についてのデータをデータセットから削除すること、
を含む、データセットにおいて正常細胞が混入した試料を同定し、混入試料をデータセットから削除するステップ、
(d)データセット内のサブグループの数rを、ピアソンの線形非類似性アルゴリズムを用いた教師なしクラスタリングをデータセットに適用することによって見積もるステップ、
(e)データセット内の各試料を、
(1)乗法的更新を100ステップ行うごとに、式(11)を用いてアルゴリズムの発散を計算するステップ、
IPC (1件)：
FI (1件)：
引用文献：
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