研究者
J-GLOBAL ID:201301008634366972   更新日: 2024年07月19日

斉藤 真司

サイトウ シンジ | Saito Shinji
所属機関・部署:
職名: 教授
ホームページURL (1件): http://dyna.ims.ac.jp/shinji/index.html
研究分野 (1件): 基礎物理化学
研究キーワード (12件): ガラス転移 ,  一分子反応 ,  酵素反応 ,  水 ,  揺らぎ、緩和現象 ,  化学反応 ,  高次非線形多次元振動分光法 ,  分子シミュレーション ,  動的不均一 ,  多時間相関関数 ,  過冷却水 ,  相転移ダイナミクス
競争的資金等の研究課題 (27件):
  • 2021 - 2026 高等植物の光捕集アンテナタンパク質における効率的励起エネルギー移動の理論研究
  • 2016 - 2021 構造揺らぎ・構造変化に基づく生体分子の機能発現の理論的解明
  • 2018 - 2020 水の局所構造と水素結合ダイナミクス:過冷却水と二成分液体
  • 2014 - 2018 分子シミュレーションによる生体分子系における励起エネルギー移動の理論的解明
  • 2014 - 2017 酸素同位体の水を用いたメガヘルツから中赤外領域におけるスペクトルの完全測定
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論文 (60件):
  • Shin-ichi Koda, Shinji Saito. A Flat-bottom Elastic Network Model for Generating Improved Plausible Reaction Paths. 2024
  • Yoshihiko Furuike, Yasuhiro Onoue, Shinji Saito, Toshifumi Mori, Shuji Akiyama. The priming phosphorylation of KaiC is activated by the release of its autokinase autoinhibition. 2024
  • Junichi Ono, Yoshihiro Matsumura, Toshifumi Mori, Shinji Saito. Conformational Dynamics in Proteins: Entangled Slow Fluctuations and Nonequilibrium Reaction Events. The Journal of Physical Chemistry B. 2023
  • Toshifumi Mori, Shinji Saito. Molecular Insights into the Intrinsic Dynamics and Their Roles During Catalysis in Pin1 Peptidyl-prolyl Isomerase. The Journal of Physical Chemistry B. 2022
  • Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Shin-ichi Koda, Damien Simon, Dongyan Ouyang, Kumiko Ito-Miwa, Shinji Saito, Eiki Yamashita, Taeko Nishiwaki-Ohkawa, Kazuki Terauchi, et al. Regulation mechanisms of the dual ATPase in KaiC. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2022. 119. 19
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MISC (23件):
  • 中村浩章, 中村浩章, 宮西寿典, 藤原進, 水口朋子, 安永卓生, 中田彩子, 宮崎剛, 大塚教雄, 剣持貴弘, et al. DNAテロメア構造のトリチウムのβ崩壊による構造崩壊. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2020. 75. 1. 2791-2791
  • Toshifumi Mori, Shinji Saito. Static and Dynamic Roles of Proteins in Proline Isomerization Reactions. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 498A-498A
  • Toshifumi Mori, Shinji Saito. Dynamic Heterogeneity and the Role of Non-Native Contacts in the Protein Folding/Unfolding Transitions. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 361A-361A
  • Toshifumi Mori, Shinji Saito. Theoretical Study of the Protein Folding Dynamics from a Time Correlation Function Approach. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2015. 108. 2. 211A-211A
  • Masahiro Higashi, Shinji Saito. Theoretical studies on excitation energy fluctuations of pigments in a light-harvesting complex. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 2014. 248
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講演・口頭発表等 (21件):
  • Supercooled water: Structure, dynamics, thermodynamics, and glass transition
    (Pacifichem 2021 2021)
  • Excitation energy transfer in the Fenna-Matthews-Olson protein optimized by site-dependent fluctuations", Symposium on Frontiers in quantum and classical molecular dynamics for complex systems, Pacifichem 2020, Honolulu, USA, Dec. 18 (2021).
    (Pacifichem 2021 2021)
  • Excitation energy transfer in the Fenna-Matthews-Olson protein optimized by site-dependent fluctuations
    (Pacifichem 2021 2021)
  • サイト依存ゆらぎによるFMOタンパク質の率的励起エネルギー移動
    (名古屋大学化学科セミナー 2021)
  • Role of fluctuation in biomolecular function: Molecular origin of efficient excitation energy transfer in the Fenna-Matthews-Olson protein
    (8th French-Japanese Workshop on Computational Methods in Chemistry 2020)
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学歴 (3件):
  • 1995 - 1995 総合研究大学院大学 数物科学研究科
  • 1988 - 1990 京都大学 大学院工学研究科 分子工学専攻
  • - 1988 慶應義塾大学 理工学部 化学科
学位 (1件):
  • 博士(理学)論文博士 (総合研究大学院大学)
経歴 (3件):
  • 2005/10 - 現在 分子科学研究所 理論・計算分子科学研究領域 教授
  • 1998/04 - 2005/09 名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 助教授
  • 1994/04 - 1998/03 名古屋大学 理学部 化学科 助手
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