松本篤幸

マツモトシゲユキ | Matsumoto Shigeyuki

所属機関・部署：
職名：特定准教授

研究分野 (1件)：構造生物化学

競争的資金等の研究課題 (8件)：

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論文 (34件)：

Yusuke Toda, Hiroaki Fujita, Koshiki Mino, Takuto Koyama, Seiji Matsuoka, Toshie Kaizuka, Mari Agawa, Shigeyuki Matsumoto, Akiko Idei, Momoko Nishikori, et al. Synergistic involvement of the NZF domains of the LUBAC accessory subunits HOIL-1L and SHARPIN in the regulation of LUBAC function. Cell Death & Disease. 2024. 15. 11
Atsushi Tokuhisa, Yoshinobu Akinaga, Yoko Sasakura, Kei Terayama, Shigeyuki Matsumoto, Takayuki Kato, Yasushi Okuno. cryoMDM; Molecular simulation Driven structural Matching Approach to Estimate Variety of Atomic Three-dimensional Model Based on Noisy cryoEM Single Particle Images. 2024
Mitsugu Araki, Toru Ekimoto, Kazuhiro Takemura, Shigeyuki Matsumoto, Yunoshin Tamura, Hironori Kokubo, Gert-Jan Bekker, Tsutomu Yamane, Yuta Isaka, Yukari Sagae, et al. Molecular Dynamics Unveils Multiple-Site Binding of Inhibitors with Reduced Activity on the Surface of Dihydrofolate Reductase. Journal of the American Chemical Society. 2024
Mai Suzuki, Ken Uchibori, Tomoko Oh-hara, Yumi Nomura, Ryusei Suzuki, Ai Takemoto, Mitsugu Araki, Shigeyuki Matsumoto, Yukari Sagae, Mutsuko Kukimoto-Niino, et al. A macrocyclic kinase inhibitor overcomes triple resistant mutations in EGFR-positive lung cancer. npj Precision Oncology. 2024
Takuto Koyama, Hayato Tsumura, Shigeyuki Matsumoto, Ryunosuke Okita, Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno. ChemGLaM: Chemical-Genomics Language Models for Compound-Protein Interaction Prediction. 2024

MISC (6件)：

Shigeyuki Matsumoto, Haruka Taniguchi-Tamura, Mitsugu Araki, Takashi Kawamura, Ryo Miyamoto, Chiemi Tsuda, Yasushi Okuno, Fumi Shima, Takashi Kumasaka, Tohru Kataoka. Novel Insights into the Structural Perturbation Induced by the Oncogenic Mutations, Q61L and Q61H, in Ras State 1. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2020. 118. 3. 42A-42A
佐伯茉帆, 槇野義輝, 松本篤幸, 河村高志, 南後恵理子, 熊坂崇, 島扶美. SACLA,SPring-8並びにNMRを用いた低分子量Gタンパク質RasのGTP加水分解過程における動的構造解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
宮口郁子, 鹿島亜季子, 佐藤美和, 中田一人, 馬彪, 松本篤幸, 徳久淳師, 大田雅照, 池口満徳. AI用学習データ作成のための高・低分解能の蛋白質結晶構造比較. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
馬場剛史, 小甲裕一, 佐藤美和, 中川寛之, 宮口郁子, MA Biao, 松本篤幸, 徳久淳師, 大田雅照, 池口満徳, et al. 3D-CNNを活用したポケット予測に関する研究。. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2019. 47th (CD-ROM)
松本篤幸, 荒木望嗣, 井阪悠太, 奥野恭史, 奥野恭史. 分子動力学計算を用いたアルデヒド脱水素酵素2(ALDH2)非活性型変異体の動的立体構造特性の解析. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st

特許 (1件)：

書籍 (5件)：

大規模MD計算によるCOVID-19治療薬探索
北隆館 2023
クライオ電子顕微鏡計測データからタンパク質の柔らかさを推定するAIシステム「DEFMap」の開発
エヌ・ティー・エヌ 2023 ISBN:9784860438043
AI・シミュレーションによる薬剤開発の迅速化
羊土社 2022
rasがん遺伝子産物Rasを分子標的としたがん治療薬開発の現状
2014
The Enzymes, Vol. 34, Inhibitors of the Ras superfamily G-proteins, Part B / Discovery of Small-Molecule Ras Inhibitors that Display Antitumor Activity by Interfering with Ras・GTP?Effector Interaction
Elsevier Inc. 2013

講演・口頭発表等 (14件)：

計算科学的アプローチによる実践的なタンパク質-化合物相互作用評価
(第97回日本薬理学会年会 2023)
Iterative Data Augmentation of near boundary negative samples Compound-Protein Interaction Prediction
(Intelligent Systems for Molecular Biology/European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 2023)
生命科学におけるAI・シミュレーション・実験融合. メディカルAIコース
(メディカルAI 2022)
MDシミュレーションと機械学習技術の融合によるcryo-EM密度マップからのタンパク質動的情報の抽出
(MOEフォーラム2022 2022)
機械学習技術と分子動力学計算を用いたcryo-EMマップからのタンパク質運動性情報の抽出
(第60回日本生物物理学会年会 2022)

学歴 (1件)：

学位 (2件)：

受賞 (4件)：

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松本 篤幸