研究者
J-GLOBAL ID:201301056914139160   更新日: 2024年10月09日

杉村 薫

スギムラ カオル | Sugimura Kaoru
所属機関・部署:
職名: 准教授
ホームページURL (1件): http://www.koolau.info/
研究分野 (3件): 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 ,  生物物理学 ,  発生生物学
研究キーワード (8件): ベイズ統計 ,  ショウジョウバエ ,  パターン形成 ,  形態形成 ,  ソフトマター ,  力学 ,  アクチン細胞骨格 ,  細胞間接着
競争的資金等の研究課題 (9件):
  • 2018 - 2021 生体組織の成長を理解するための新規力学モデルの発展と応用
  • 2017 - 2020 細胞配置換えの速度と方向を決定する分子・力学メカニズムの解明
  • 2017 - 2019 細胞競合力学制御の解明のための力推定法の開発と応用
  • 2015 - 2017 外力が駆動する細胞集団運動を支えるアクチン細胞骨格制御の解明
  • 2014 - 2017 器官形態形成における粘弾性動力学モデルの構築および数値計算による解析
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論文 (43件):
  • Kaoru Sugimura, Tetsuhisa Otani. Vertex remodeling during epithelial morphogenesis. Current Opinion in Cell Biology. 2024. 91. 102427-102427
  • Xin Yan, Goshi Ogita, Shuji Ishihara, Kaoru Sugimura. Bayesian parameter inference for epithelial mechanics. 2024
  • Estelle Gauquelin, Keisuke Kuromiya, Toshinori Namba, Keisuke Ikawa, Yasuyuki Fujita, Shuji Ishihara, Kaoru Sugimura. Mechanical convergence in mixed populations of mammalian epithelial cells. The European physical journal. E, Soft matter. 2024. 47. 3. 21-21
  • Keisuke Ikawa, Souta Hiro, Shu Kondo, Shizue Ohsawa, Kaoru Sugimura. Coronin-1 promotes directional cell rearrangement in Drosophila wing epithelium. Cell structure and function. 2023
  • Keisuke Ikawa, Shuji Ishihara, Yoichiro Tamori, Kaoru Sugimura. Attachment and detachment of cortical myosin regulates cell junction exchange during cell rearrangement in the Drosophila wing epithelium. Current Biology. 2023. 33. 2. 263-275.e4
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MISC (5件):
  • 石原秀至, 石原秀至, 杉村薫. 組織変形の定量化手法と多階層連続体モデル. 生物物理(Web). 2020. 60. 1
  • 杉村薫, 石原秀至. メカノバイオロジー IV.生体構造の力学モデリングとシミュレーション 細胞と組織をつなぐ新しいクラスの連続体モデル. 生体の科学. 2019. 70. 4
  • 石原秀至, 杉村薫. レクチャー理論生物学 生命現象の解明にむけて Series vol.2 理論生物学研究の眺め方. 蛋白質 核酸 酵素. 2009. 54. 15
  • 杉村 薫, 上村 匡, 望月 敦史. 生命現象にみられるゆらぎ・振動・波 樹状突起が空間を埋めるための自己組織化機構(Self-organizing Mechanism for Development of Space-filling Dendrites). 日本発生生物学会・日本細胞生物学会合同大会要旨集. 2007. 40回・59回. 25-25
  • 服部 佑佳子, 杉村 薫, 上村 匡. EBF/Olf-1ファミリーの転写制御因子Knot/Collierの選択的発現によるクラス特異的樹状形態形成(Selective Expression of Knot/Collier, a Transcriptional Regulator of the EBF/Olf-1 Family, Endowed a Class-specific Dendritic Morphogenesis). 日本発生生物学会・日本細胞生物学会合同大会要旨集. 2007. 40回・59回. 158-158
書籍 (3件):
  • 機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?
    羊土社 2020 ISBN:9784758103916
  • 定量生物学 (DOJIN BIOSCIENCE SERIES)
    化学同人 2018 ISBN:9784759817300
  • 理論生物学の眺め方
    共立出版 2011
講演・口頭発表等 (29件):
  • The mechanics of nature behind the multicellular tissue structure
    (第57回日本生物物理学会年会 2019)
  • 細胞配置換え過程におけるアクチン脱重合因子を介した力感知・力抵抗機構
    (第92回日本生化学会大会 2019)
  • 数理と実験で解き明かす生体組織の成長メカニズム
    (理化学研究所数理創造プログラム特別講演会 2018)
  • Quantifying and modelling epithelial morphogenesis.
    (The Joint Meeting of the Society for Mathematical Biology and the Japanese Society for Mathematical Biology 2018)
  • Quantifying and modelling epithelial morphogenesis.
    (iCeMS-iTHEMS Joint Workshop on Interdisciplinary Biology 2018)
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学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (3件):
  • 2021/01 - 現在 東京大学 理学部生物情報科学科 准教授
  • 2017 - 2020/12 京都大学 高等研究院物質細胞統合システム拠点 特定拠点准教授
  • 2011 - 京都大学 物質細胞統合システム拠点 特定拠点助教
受賞 (4件):
  • 2023 - ナイスステップな研究者
  • 2020 - 花王科学賞
  • 2020 - 京都大学たちばな賞
  • 2014 - 日本生物物理学会若手奨励賞
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