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J-GLOBAL ID：201302200510406307   整理番号：13A0850013

低温電子顕微鏡および質量分析から得られたCOPIIケージの偽原子モデル

A pseudoatomic model of the COPII cage obtained from cryo-electron microscopy and mass spectrometry

著者 (7件)： NOBLE Alex J (Florida State Univ., Florida, USA) ,  ZHANG Qian (Florida State Univ., Florida, USA) ,  O’DONNELL Jason (Florida State Univ., Florida, USA) ,  HARIRI Hanaa (Florida State Univ., Florida, USA) ,  BHATTACHARYA Nilakshee (Florida State Univ., Florida, USA) ,  MARSHALL Alan G (Florida State Univ., Florida, USA) ,  STAGG Scott M (Florida State Univ., Florida, USA)
資料名： Nature Structural & Molecular Biology  (Nature Structural & Molecular Biology)
巻： 20  号： 2  ページ： 167-173  発行年： 2013年02月 
JST資料番号： W0637A  ISSN： 1545-9993  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： COPIIケージの会合および可動性において重要なSec13およびSec31の三次構造の詳細を明らかにするために,ヒトCOPIIケージの低温電子顕微鏡(EM)を用いた解析を行った。低温EMにより12Åの解像度でCOPIIケージの三次構造が得られ,COPIIケージが中心に2対のSec13-31を持つヘテロ四量体であることが分かった。酵母のSec13-Sec31の結晶構造との比較からCOPIIケージの偽原子モデルを構築し,溶媒露出面積を計算することでケージ内の結合に関わるアミノ酸残基の同定を行った。この偽原子モデルおよび水素/重水素交換質量分析を組み合わせることで,COPIIケージの四つの異なる接触領域cI-cIVを同定することができた。これらの結果から,Sec13-Sec31におけるSec31二量体領域の二回転対称がケージ形成に際して壊4れ,その結果生じるヒンジ構造がCOPIIケージの正しい幾可学的形状に必要であり,ヒンジ構造の剛性にSec13が寄与することが分かった。

シソーラス用語： *タンパク質複合体 ,  *被覆小胞 ,  電子顕微鏡観察 ,  *膜タンパク質 ,  細胞内輸送 ,  Golgi体 ,  小胞体 ,  四量体 ,  結晶構造 ,  結合部位 ,  アミノ酸残基 ,  原子モデル ,  同位体交換 ,  質量分析
準シソーラス用語： *COPII ,  *Sec31蛋白質 ,  *Sec蛋白質 ,  ヘテロ四量体 ,  水素/重水素交換 ,  蛋白質輸送 ,  低温電子顕微鏡観察

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： 低温電子顕微鏡 ,  質量分析 ,  COPII ,  ケージ ,  原子モデル