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J-GLOBAL ID：201302217228364898   整理番号：13A0358242

トマト果実の発生に関する1塩基分解能のメチロームが明らかにした成熟にかかわるエピゲノム修飾

Single-base resolution methylomes of tomato fruit development reveal epigenome modifications associated with ripening

著者 (15件)： ZHONG Silin (Cornell Univ., New York, USA) ,  FEI Zhangjun (Cornell Univ., New York, USA) ,  CHEN Yun-Ru (Cornell Univ., New York, USA) ,  ZHENG Yi (Cornell Univ., New York, USA) ,  HUANG Mingyun (Cornell Univ., New York, USA) ,  VREBALOV Julia (Cornell Univ., New York, USA) ,  MCQUINN Ryan (Cornell Univ., New York, USA) ,  GAPPER Nigel (Cornell Univ., New York, USA) ,  GIOVANNONI James J (Cornell Univ., New York, USA) ,  ZHONG Silin (Northeast Normal Univ., Changchun, CHN) ,  LIU Bao (Northeast Normal Univ., Changchun, CHN) ,  FEI Zhangjun (Agriculture Res. Serv., US Dep. of Agriculture, New York, USA) ,  GIOVANNONI James J (Agriculture Res. Serv., US Dep. of Agriculture, New York, USA) ,  XIANG Jenny (Cornell Univ., New York, USA) ,  SHAO Ying (Cornell Univ., New York, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 31  号： 2  ページ： 154-159  発行年： 2013年02月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トマト果実の成熟は植物ホルモンのエチレンによって引き起こされるが,その作用は,成長可能な種子を含む果実を成熟させる未知の発生的要因によって制限される。この発生的要因に後生的な再構成が含まれるのかどうかを明らかにするため,トマトをメチルトランスフェラーゼ阻害剤5-アザシチジンで処理したところ,果実は早期に熟した。我々は,未成熟から成熟に至る4つの発生段階の果実を対象に,亜硫酸水素塩を用いる全ゲノム塩基配列解読を行った。その結果,今回の解析でカバーされたゲノムの90%に5万2,095か所の差次的メチル化領域が発見された(ゲノムの1%)。さらに,主要な成熟関連転写因子の1つであるRINの結合部位は,数多くの成熟関連遺伝子のプロモーターの脱メチル化領域に局在する場合が多く,その結合は脱メチル化と協調して生じていた。今回の結果は,エピゲノムが発生中に静的でなく,果実の成熟をはじめとする発生過程の正確さを確保するように選択されてきた可能性があることを示している。作物の改良戦略では,植物系統のDNA配列の多様性のみならず,エピゲノムにコードされた情報をも考慮するほうが有利と考えられる。Copyright Nature Publishing Group 2013

シソーラス用語： *成熟 ,  *トマト ,  *植物成長調整剤 ,  酵素阻害剤 ,  遺伝学 ,  ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  *転写因子 ,  脱メチル ,  結合部位 ,  作物育種 ,  メチル化 ,  リボヌクレオシド ,  アルケン
準シソーラス用語： *DNAメチル化 ,  *RIN蛋白質 ,  エピゲノム ,  カテコールO-メチルトランスフェラーゼ阻害剤 ,  ゲノミクス ,  *果実の熟成 ,  差次的メチル化領域 ,  全ゲノム塩基配列解読

分類 (5件)： 植物ホルモン  (EH02070M) ,  植物成長調整剤  (FB06060M) ,  野菜  (FC03043X) ,  作物育種一般  (FC02010K) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

物質索引 (2件)： 5-アザシチジン ,  エチレン

タイトルに関連する用語 (7件)： トマト ,  果実 ,  塩基 ,  分解能 ,  成熟 ,  エピゲノム ,  修飾