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J-GLOBAL ID：201302220133827905   整理番号：13A1778000

Arabidopsis thaliana葉緑体の「タンパク質複合体プロテオーム」

The ‘protein complex proteome’ of chloroplasts in Arabidopsis thaliana

著者 (6件)： BEHRENS Christof (Inst. of Plant Genetics, Fac. of Natural Sciences, Leibniz Universitaet Hannover, Herrenhaeuser Str. 2, D-30419 ...) ,  BLUME Christian (Inst. of Botany, Fac. of Natural Sciences, Leibniz Universitaet Hannover, Herrenhaeuser Str. 2, D-30419 Hannover, DEU) ,  SENKLER Michael (Inst. of Plant Genetics, Fac. of Natural Sciences, Leibniz Universitaet Hannover, Herrenhaeuser Str. 2, D-30419 ...) ,  EUBEL Holger (Inst. of Plant Genetics, Fac. of Natural Sciences, Leibniz Universitaet Hannover, Herrenhaeuser Str. 2, D-30419 ...) ,  PETERHAENSEL Christoph (Inst. of Botany, Fac. of Natural Sciences, Leibniz Universitaet Hannover, Herrenhaeuser Str. 2, D-30419 Hannover, DEU) ,  BRAUN Hans-peter (Inst. of Plant Genetics, Fac. of Natural Sciences, Leibniz Universitaet Hannover, Herrenhaeuser Str. 2, D-30419 ...)
資料名： Journal of Proteomics  (Journal of Proteomics)
巻： 91  ページ： 73-83  発行年： 2013年10月08日 
JST資料番号： T0073A  ISSN： 1874-3919  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本稿では,Arabidopsis thaliana葉緑体の「タンパク質複合体プロテオーム」の最初のGelMapを提示する。GelMapソフトウェアツールは最新の質量分析システムの高い感度を利用して複数のタンパク質をゲルスポットに帰属させることを可能にする。更に,このソフトウェアは全ての同定したタンパク質の機能的注釈付けを可能にする。2Dブルーネイティブ(BN)/SDSゲルに適用すると,GelMapは低存在量のタンパク質複合体を選択的に示すことができる。葉緑体GelMapのために,高度に精製したオルガネラを2D BN/SDS PAGEにより分離し,Delta 2Dソフトウェアを用いてスポットを自動的に検出した。287のスポットで,1841のタンパク質を同定した(スポット当たり平均6.4個のタンパク質)。これは436の非冗長タンパク質のセットに相当する。これらのタンパク質の大多数はタンパク質複合体の一部を形成する。このマップの質は,文献で葉緑体に関し記述されているタンパク質複合体のおおよそ完全なセットを含んでいることに反映されている。このGelMapはwww.gelmap.de/arabidopsis-chloroにて公開されており,その何れかの機能カテゴリー内の新規タンパク質複合体の同定のためのリソースとして用いることが出来る。生物学的意義:葉緑体GelMapはモデル植物A.thalianaのタンパク質複合体の明確化のためのデータリソースを代表する。これまで未知のタンパク質複合体の発見により例証されるように,葉緑体生化学の詳細な理解のために有用であるはずである。このGelMapはwww.gelmap.de/arabidopsis-chloroにて公開されている。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *タンパク質複合体 ,  プロテオーム ,  葉緑体 ,  二次元電気泳動 ,  *プログラムパッケージ ,  ゲル電気泳動 ,  SDS-PAGE ,  質量分析 ,  *植物タンパク質 ,  アノテーション ,  *葉緑体タンパク質 ,  シロイヌナズナ ,  BN-PAGE【電気泳動】
準シソーラス用語： Arabidopsis thaliana ,  BN-PAGE ,  *GelMap

分類 (2件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： Arabidopsis ,  葉緑体 ,  タンパク質複合体 ,  プロテオーム