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J-GLOBAL ID：201302222711707325   整理番号：13A0906569

太平洋の白エビLitopenaeus vannameiのBAC最終シーケンシング:Penaeidエビのゲノムの一瞥

BAC end sequencing of Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei: a glimpse into the genome of Penaeid shrimp

著者 (7件)： Zhao Cui (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...) ,  Zhang Xiaojun (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...) ,  Liu Chengzhang (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...) ,  Huan Pin (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...) ,  Li Fuhua (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...) ,  Xiang Jianhai (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...) ,  Huang Chao (Inst. of Oceanology, Chinese Acad. of Sciences Key Lab. of Experimental Marine Biology, Chinese Acad. of Sciences ...)
資料名： Chinese Journal of Oceanology and Limnology  (Chinese Journal of Oceanology and Limnology)
巻： 30  号： 3  ページ： 456-470  発行年： 2012年 
JST資料番号： W1447A  ISSN： 0254-4059  CODEN： CJOEO  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Sangerシーケンシングによって挿入物の2末端からのBACライブラリーLvHEから7812のBACクローンを選び,並べた。品質フィルタリング後に,4609のペア末端BESを含む11279のBAC末端シーケンス(BES)を得た。BESの解析によると,L.vannameiゲノムはAT豊富で,一次反復パターンは単純なシーケンス列反復(SSR)および低複雑性シーケンスであった。ジヌクレオチドとhexanucleotide反復はBESで最も一般的なSSR型であった。最も豊富な転移因子はジプシーで,L.vannameiの大ゲノム規模の生成に寄与した。免疫と性決定に含まれる遺伝子を含めて,BLAST探索により成功裡に4519BESを注釈付けした。この結果は機能的な遺伝子研究,地図構築および統合のために重要な資源を提供し,この種に対し完全ゲノム集合を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： 太平洋 ,  *クルマエビ ,  ゲノム ,  遺伝子 ,  ジヌクレオチド
準シソーラス用語： *Litopenaeus vannamei ,  Penaeid ,  シーケンス

分類 (1件)： 魚類以外の水産動物  (FH02030V)

タイトルに関連する用語 (6件)： 太平洋 ,  白 ,  エビ ,  Litopenaeus ,  BAC ,  ゲノム