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J-GLOBAL ID：201302233954239631   整理番号：13A1202163

HIV-1抗体2G12とMan₉GlcNAc₂配位子との相互作用解析:フラグメント分子軌道とMD法による理論計算

Interaction analysis of HIV-1 antibody 2G12 and Man₉GlcNAc₂ ligand: Theoretical calculations by fragment molecular orbital and MD methods

著者 (3件)： KOYAMA Yuka (Dep. of Chemistry and Biochemistry, Graduate School of Humanities and Sciences, Ochanomizu Univ., 2-1-1 Otsuka ...) ,  UENO-NOTO Kaori (Center for Natural Sciences, Coll. of Liberal Arts and Sciences, Kitasato Univ., 1-15-1 Kitasato, Minami-ku ...) ,  TAKANO Keiko (Dep. of Chemistry and Biochemistry, Graduate School of Humanities and Sciences, Ochanomizu Univ., 2-1-1 Otsuka ...)
資料名： Chemical Physics Letters  (Chemical Physics Letters)
巻： 578  ページ： 144-149  発行年： 2013年07月18日 
JST資料番号： B0824A  ISSN： 0009-2614  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIV-1感染において,ヒト抗体2G12は,HIV-1表面糖タンパク質,gp120の上に高マンノース型グリカンを認識できる。治療に寄与する目的で糖鎖を有する抗体2G12の配位子結合メカニズムを調べるために,古典的な分子動力学(MD)シミュレーションとab initioフラグメント分子軌道(FMO)計算を,高マンノース配位子を持つ抗体2G12錯体について行った。私たちは,配位子のマンノースD1は抗体と最大の結合親和性を持っていて,これは実験報告と良く一致していることを見出した。さらに,配位子結合においてマンノース4,4’の重要な役割を理論的に示した。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *HIV1 ,  *抗体 ,  *感染 ,  *ヒト ,  グリコシド ,  多糖類 ,  *錯体生成 ,  分子動力学 ,  ab initio法 ,  *分子軌道法 ,  *親和性 ,  ヘキソース ,  アルドース
準シソーラス用語： フラグメント分子軌道法 ,  結合親和性

分類 (1件)： 抗原・抗体・補体の生化学  (ED04020L)

物質索引 (1件)： マンノース

タイトルに関連する用語 (9件)： HIV-1 ,  抗体 ,  配位子 ,  相互作用 ,  解析 ,  フラグメント ,  分子軌道 ,  MD法 ,  理論計算